More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1372 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  100 
 
 
225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  79.56 
 
 
225 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  79.11 
 
 
225 aa  345  3e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0525  uridylate kinase  78.67 
 
 
225 aa  343  1e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  71.56 
 
 
225 aa  332  3e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  49.77 
 
 
234 aa  189  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1975  uridylate kinase  42.98 
 
 
230 aa  178  7e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3479  uridylate kinase  45.61 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1510  uridylate kinase  45.18 
 
 
242 aa  170  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1294  uridylate kinase  44.23 
 
 
239 aa  166  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1152  uridylate kinase, putative  45.13 
 
 
223 aa  165  5e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1036  uridylate kinase, putative  41.47 
 
 
234 aa  164  8e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2386  uridylate kinase  44.54 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110359  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  40.62 
 
 
236 aa  160  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  39.29 
 
 
235 aa  154  7e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0788  uridylate kinase  43.52 
 
 
233 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.020264 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1964  uridylate kinase  40.99 
 
 
229 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.082157  normal  0.015373 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0760  uridylate kinase, putative  40.19 
 
 
234 aa  139  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.80494  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  40 
 
 
226 aa  137  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1705  uridylate kinase, putative  38.05 
 
 
227 aa  123  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.118956 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  36.28 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0629  uridylate kinase, putative  33.05 
 
 
226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  38.51 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2085  uridylate kinase  29.91 
 
 
231 aa  105  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00820156  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  33.49 
 
 
232 aa  102  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1804  uridylate kinase  32.02 
 
 
217 aa  95.9  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0530  uridylate kinase  33.18 
 
 
217 aa  93.6  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.390373  normal  0.0202207 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0482  uridylate kinase  28.51 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0583  uridylate kinase  30.74 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1665  uridylate kinase  31.36 
 
 
217 aa  85.1  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0833917  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0828  uridylate kinase  27.27 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  31.09 
 
 
237 aa  82  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  30.67 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  31.06 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4151  uridylate kinase  32.23 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0537318  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3279  uridylate kinase  27.73 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00055393  hitchhiker  0.000297429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2855  uridylate kinase  31.82 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654259  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  31.22 
 
 
237 aa  78.2  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2826  uridylate kinase  30.81 
 
 
238 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  31.22 
 
 
237 aa  78.2  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  30.08 
 
 
235 aa  78.2  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2633  uridylate kinase  28.03 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000396495  normal  0.230715 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  30 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  31.52 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  30 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  29.89 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  30.43 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  30.43 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  30.43 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103165  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  28.63 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  30.43 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  33.7 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  33.67 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  33.67 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  33.67 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  32.96 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4515  uridylate kinase  30.73 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  32.14 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  28.57 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  31.53 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0585  uridylate kinase  31.17 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.250613  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  29.34 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3159  uridylate kinase  29.89 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000796421  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  29.83 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  28.57 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  28.57 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  28.99 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  30.98 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  31.52 
 
 
241 aa  75.1  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  28.99 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1613  uridylate kinase  31.36 
 
 
217 aa  74.7  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.52534  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  29.88 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  30.48 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  30.48 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2292  uridylate kinase  32.74 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41797  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3266  uridylate kinase  29.9 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623734  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3788  uridylate kinase  31.52 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  28.75 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  29.39 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  30.77 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  34.88 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  29.89 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00169  uridylate kinase  28.15 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0505974  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3432  uridylate kinase  28.15 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0174185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3489  uridylate kinase  28.15 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.257153  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  27.62 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0182  uridylate kinase  28.15 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0585328  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1319  uridylate kinase  29.29 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.169344 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  31.72 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0164  uridylate kinase  28.15 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0156878  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1518  uridylate kinase  27.62 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1721  uridylate kinase  27.73 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  28.78 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0173  uridylate kinase  28.15 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120351  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0181  uridylate kinase  28.15 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000366692  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1272  uridylate kinase  27.62 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00989068  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0175  uridylate kinase  28.15 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000281467  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1141  uridylate kinase  28.8 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000922759  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1555  uridylate kinase  29.35 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  31.43 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>