More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1613 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1613  uridylate kinase  100 
 
 
217 aa  440  1e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.52534  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0530  uridylate kinase  77.88 
 
 
217 aa  340  1e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.390373  normal  0.0202207 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1804  uridylate kinase  75.93 
 
 
217 aa  320  9.999999999999999e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1665  uridylate kinase  75.58 
 
 
217 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0833917  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0629  uridylate kinase, putative  42.67 
 
 
226 aa  175  5e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  42.86 
 
 
226 aa  152  4e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  39.53 
 
 
224 aa  143  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1705  uridylate kinase, putative  39.01 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.118956 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1036  uridylate kinase, putative  36.77 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  38.62 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  38.76 
 
 
234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1152  uridylate kinase, putative  36.2 
 
 
223 aa  124  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  37.27 
 
 
235 aa  122  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  36.28 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  35.5 
 
 
232 aa  116  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  35.45 
 
 
224 aa  115  6e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  35.56 
 
 
225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0760  uridylate kinase, putative  37.43 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.80494  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  36.28 
 
 
225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0788  uridylate kinase  37.96 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.020264 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0525  uridylate kinase  35.84 
 
 
225 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1964  uridylate kinase  35.39 
 
 
229 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.082157  normal  0.015373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4515  uridylate kinase  33.47 
 
 
238 aa  101  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2085  uridylate kinase  30.13 
 
 
231 aa  99  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00820156  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1975  uridylate kinase  33.04 
 
 
230 aa  99  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1857  uridylate kinase  32.63 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1510  uridylate kinase  33.93 
 
 
242 aa  95.5  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2386  uridylate kinase  36.16 
 
 
241 aa  95.1  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110359  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2438  uridylate kinase  32.35 
 
 
238 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139798  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  33.05 
 
 
238 aa  94  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3266  uridylate kinase  31.51 
 
 
238 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623734  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  32.84 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2855  uridylate kinase  31.93 
 
 
238 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654259  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3479  uridylate kinase  31.7 
 
 
241 aa  88.6  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1294  uridylate kinase  33.16 
 
 
239 aa  87.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2826  uridylate kinase  30.58 
 
 
238 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  28.81 
 
 
235 aa  85.9  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  31.65 
 
 
263 aa  85.9  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0744  uridylate kinase  30.77 
 
 
242 aa  85.5  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000716266  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  31.67 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  30.67 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0678  uridylate kinase  31.54 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0224373  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  30.71 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  31.25 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  31.71 
 
 
245 aa  82.4  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  30 
 
 
240 aa  81.6  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  30.51 
 
 
251 aa  81.6  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06760  uridylate kinase  31.8 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000401703  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  32.24 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  32.24 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  28.33 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  31.09 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1842  uridylate kinase  32.64 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  27.31 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  27.31 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  27.31 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  28.24 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  28.24 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  27.31 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  27.31 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3788  uridylate kinase  27.92 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  27.31 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  28.24 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  28.24 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  28.24 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  27.31 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1964  uridylate kinase  32.78 
 
 
234 aa  79  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.86122  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  27.31 
 
 
286 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  29.17 
 
 
241 aa  79  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  31.07 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  29.17 
 
 
241 aa  79  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1369  uridylate kinase  30.71 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.237197  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  27.31 
 
 
237 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  26.78 
 
 
235 aa  78.2  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  31.4 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3279  uridylate kinase  28.15 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00055393  hitchhiker  0.000297429 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3159  uridylate kinase  27.73 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000796421  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  30.13 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  29.61 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  27.31 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  30.83 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  31.25 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  28.15 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  29.61 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  28.57 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  30.09 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  26.85 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  28.18 
 
 
236 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  27.73 
 
 
242 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  26.85 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  28.39 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  29.61 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  27.5 
 
 
244 aa  77  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  32.22 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  31.25 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  29.17 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0527  uridylate kinase  29.33 
 
 
246 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105771  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  31.19 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  26.85 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  27.78 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>