More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1842 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1842  uridylate kinase  100 
 
 		 241 aa  491  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  58.8 
 
 		 251 aa  279  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  58.8 
 
 		 251 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  58.8 
 
 		 251 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  59.21 
 
 		 238 aa  274  7e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  58.72 
 
 		 249 aa  273  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  56.49 
 
 		 246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  54.74 
 
 		 238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  56.03 
 
 		 244 aa  268  4e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  56.03 
 
 		 241 aa  268  4e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  57.14 
 
 		 235 aa  268  5e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1449  uridylate kinase  57.14 
 
 		 236 aa  267  8.999999999999999e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  56.52 
 
 		 236 aa  267  1e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  54.78 
 
 		 234 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  56.22 
 
 		 239 aa  267  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  56.9 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  53.62 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  55.74 
 
 		 239 aa  266  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  56.9 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  56.9 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  54.27 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  56.28 
 
 		 236 aa  265  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  53.91 
 
 		 234 aa  265  7e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  52.54 
 
 		 238 aa  264  8.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  57.59 
 
 		 237 aa  263  1e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  56.71 
 
 		 236 aa  263  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  57.45 
 
 		 263 aa  263  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  53.48 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  56.9 
 
 		 236 aa  263  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  55.41 
 
 		 242 aa  262  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  55.41 
 
 		 237 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  53.81 
 
 		 274 aa  261  4.999999999999999e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  55.22 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  55.36 
 
 		 239 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  56.5 
 
 		 237 aa  261  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  53.91 
 
 		 234 aa  261  8e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  54.2 
 
 		 237 aa  261  8.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  54.98 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  54.98 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  54.98 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  55.41 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  55.65 
 
 		 241 aa  261  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  54.98 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  54.98 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  56.09 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  55.08 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  54.78 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  54.98 
 
 		 237 aa  259  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  53.16 
 
 		 238 aa  260  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  54.98 
 
 		 245 aa  259  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  55.65 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  55.27 
 
 		 253 aa  260  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  55.41 
 
 		 241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  54.11 
 
 		 237 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0585  uridylate kinase  53.85 
 
 		 239 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.250613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  54.11 
 
 		 237 aa  258  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  54.11 
 
 		 237 aa  258  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  54.11 
 
 		 237 aa  258  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  54.11 
 
 		 237 aa  258  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  54.11 
 
 		 237 aa  258  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  54.11 
 
 		 237 aa  258  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  55.41 
 
 		 239 aa  258  7e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  54.55 
 
 		 236 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  55.84 
 
 		 239 aa  258  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  54.11 
 
 		 286 aa  258  8e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  53.33 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  54.7 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  53.48 
 
 		 242 aa  257  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  53.71 
 
 		 237 aa  257  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  53.68 
 
 		 245 aa  257  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  54.11 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  54.11 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  54.11 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  55.22 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  54.82 
 
 		 235 aa  256  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  54.04 
 
 		 242 aa  256  3e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  53.48 
 
 		 242 aa  255  4e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  54.11 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  53.48 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  53.85 
 
 		 245 aa  255  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  55.65 
 
 		 239 aa  255  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  53.68 
 
 		 236 aa  255  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  55.17 
 
 		 239 aa  255  5e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  53.68 
 
 		 236 aa  255  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  54.7 
 
 		 255 aa  254  7e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  53.59 
 
 		 249 aa  254  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  55.56 
 
 		 241 aa  254  7e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  55.56 
 
 		 241 aa  254  7e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  53.68 
 
 		 236 aa  254  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  53.85 
 
 		 245 aa  254  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  54.74 
 
 		 240 aa  254  8e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  50.64 
 
 		 245 aa  254  9e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  53.19 
 
 		 247 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  53.85 
 
 		 247 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  53.68 
 
 		 236 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  53.85 
 
 		 247 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  53.02 
 
 		 246 aa  253  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  53.22 
 
 		 235 aa  254  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  53.25 
 
 		 236 aa  253  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  55.42 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>