More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1267 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1267  uridylate kinase  100 
 
 		 231 aa  464  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.761618  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  97.4 
 
 		 231 aa  455  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0828  uridylate kinase  57.21 
 
 		 234 aa  271  4.0000000000000004e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0482  uridylate kinase  55.02 
 
 		 233 aa  269  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1721  uridylate kinase  56.83 
 
 		 232 aa  267  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  45.92 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  45.92 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  45.49 
 
 		 237 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  45.41 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  45.06 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  45.06 
 
 		 237 aa  197  9e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  43.29 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1842  uridylate kinase  45.98 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0502  uridylate kinase  46.22 
 
 		 238 aa  195  5.000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  44.54 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  44.64 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  46.19 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  44.98 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  44.98 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  44.98 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  44.78 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  43.78 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3788  uridylate kinase  42.36 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  45.22 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  44.54 
 
 		 242 aa  192  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  44.98 
 
 		 240 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0744  uridylate kinase  44.44 
 
 		 242 aa  191  9e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000716266  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  45.06 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  44.21 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  44.64 
 
 		 240 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1555  uridylate kinase  42.79 
 
 		 247 aa  189  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  41.92 
 
 		 241 aa  189  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  43.35 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  42.36 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  44.64 
 
 		 240 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  42.36 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2974  uridylate kinase  43.23 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  43.48 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0678  uridylate kinase  42.42 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0224373  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  42.06 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3266  uridylate kinase  45.74 
 
 		 238 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623734  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  43.67 
 
 		 236 aa  188  7e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  42.79 
 
 		 242 aa  188  7e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  41.05 
 
 		 239 aa  187  8e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  43.04 
 
 		 242 aa  187  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  43.35 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  43.4 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  42.36 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1449  uridylate kinase  43.67 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  44.1 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  43.35 
 
 		 236 aa  185  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  41.2 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  43.23 
 
 		 240 aa  185  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  42.49 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  42.79 
 
 		 244 aa  185  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  42.49 
 
 		 245 aa  185  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  42.06 
 
 		 234 aa  185  6e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1556  uridylate kinase  42.36 
 
 		 243 aa  184  7e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249994  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  43.23 
 
 		 240 aa  184  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  44.1 
 
 		 236 aa  184  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  44.1 
 
 		 236 aa  184  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  41.48 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  42.92 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  41.48 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103165  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  41.48 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0481  uridylate kinase  44.75 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0943  uridylate kinase  41.92 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00384678  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  41.48 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  42.49 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2844  uridylate kinase  45.65 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000917545  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  42.06 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  40.85 
 
 		 279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  41.48 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  43.23 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1857  uridylate kinase  44.78 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  41.05 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  42.49 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  42.79 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  42.06 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3163  uridylate kinase  41.48 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00169  uridylate kinase  41.92 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0505974  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3432  uridylate kinase  41.92 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0174185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3489  uridylate kinase  41.92 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.257153  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  42.79 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  42.79 
 
 		 286 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  42.79 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  43.23 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3159  uridylate kinase  41.92 
 
 		 245 aa  182  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000796421  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0182  uridylate kinase  41.92 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0585328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  43.67 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  42.79 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  42.36 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  42.36 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  42.79 
 
 		 258 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0175  uridylate kinase  41.92 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000281467  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0181  uridylate kinase  41.92 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000366692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  42.79 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0164  uridylate kinase  41.92 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0156878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  42.79 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  42.79 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>