50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0545 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0545  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 175 aa  365  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2117  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.96 
 
 		 195 aa  91.3  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00158441  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0754  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.92 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.43 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1780  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.22 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2018  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.11 
 
 		 242 aa  48.5  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250351  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2365  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.4 
 
 		 242 aa  48.5  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000172168  hitchhiker  0.00918938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2559  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.86 
 
 		 242 aa  48.1  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  30.77 
 
 		 1367 aa  48.1  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  30.77 
 
 		 1367 aa  48.1  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2157  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.59 
 
 		 242 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000679182  normal  0.0877249 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2234  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.59 
 
 		 242 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000877394  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0501  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.07 
 
 		 238 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  25.29 
 
 		 1493 aa  45.8  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2204  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.28 
 
 		 242 aa  44.7  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000174809  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1993  DNA-directed DNA polymerase  26.11 
 
 		 242 aa  44.7  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000133992  hitchhiker  0.00000148516 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0194  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.43 
 
 		 231 aa  44.3  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2858  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.08 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.629828  normal  0.501512 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2323  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.44 
 
 		 242 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00003917  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2063  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.44 
 
 		 242 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000471549  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3448  DNA polymerase III subunit epsilon  23.7 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2015  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.44 
 
 		 242 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000147945  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2815  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.15 
 
 		 239 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2000  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.44 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000879357  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2071  DNA polymerase III subunit epsilon  25.58 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  25.27 
 
 		 1421 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1719  ribonuclease T  26.92 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00130888  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1991  DNA polymerase III subunit epsilon  25.58 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.71 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1399  ribonuclease T  26.97 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415119  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0029  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  23.64 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.929727  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2814  DNA polymerase III, epsilon subunit  21.69 
 
 		 243 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1920  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  23.4 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.931749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1638  DNA polymerase III, epsilon subunit, putative  23.4 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.400233  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.15 
 
 		 237 aa  42  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  24.71 
 
 		 1390 aa  42.4  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2402  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.67 
 
 		 242 aa  41.6  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000797972  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1764  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.58 
 
 		 191 aa  41.6  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.387329  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1397  ribonuclease T  24.67 
 
 		 226 aa  41.6  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1866  ribonuclease T  32.95 
 
 		 246 aa  41.6  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00131644  normal  0.0390394 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1662  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.88 
 
 		 232 aa  41.6  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.862026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1618  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.56 
 
 		 234 aa  41.6  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.910547  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02742  ribonuclease T  27.06 
 
 		 210 aa  41.2  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0139  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.7 
 
 		 190 aa  41.2  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0192788 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0728  ribonuclease T  29.93 
 
 		 226 aa  41.2  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1880  DNA-directed DNA polymerase  24.58 
 
 		 242 aa  41.2  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  21.59 
 
 		 237 aa  41.2  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.58 
 
 		 239 aa  41.2  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1763  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.2 
 
 		 236 aa  40.8  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.312232 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1825  DNA polymerase III subunit epsilon  25.41 
 
 		 247 aa  40.8  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>