31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0754 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0754  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 205 aa  418  1e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2117  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  54.08 
 
 		 195 aa  211  9e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00158441  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0545  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.92 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1161  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.21 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  26.52 
 
 		 1421 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  22.89 
 
 		 721 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  22.05 
 
 		 226 aa  45.8  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  26.23 
 
 		 1464 aa  45.4  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  25.13 
 
 		 1444 aa  45.1  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0371  DNA polymerase III, alpha subunit  22.17 
 
 		 1485 aa  43.5  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1920  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  31.14 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.931749  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0588  putative exonuclease  27.43 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2482  DNA-directed DNA polymerase  27.08 
 
 		 168 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0240  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  21.97 
 
 		 302 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0011  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.73 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.536124  hitchhiker  0.000865916 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0626  exonuclease, putative  27.43 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0689924  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  21.54 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1638  DNA polymerase III, epsilon subunit, putative  29.82 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.400233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2137  DNA polymerase III, epsilon subunit  22.7 
 
 		 864 aa  42.4  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  21.63 
 
 		 242 aa  42  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  27.93 
 
 		 584 aa  42  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  27.03 
 
 		 1433 aa  41.6  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  27.03 
 
 		 1433 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  27.03 
 
 		 1433 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  27.03 
 
 		 1433 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  27.03 
 
 		 1433 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  27.03 
 
 		 1433 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  27.03 
 
 		 1433 aa  41.6  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2053  putative PAS/PAC sensor protein  29.91 
 
 		 714 aa  41.6  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115114 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2613  DNA polymerase III subunit  20.48 
 
 		 222 aa  41.6  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4151  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.89 
 
 		 729 aa  41.2  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.488762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>