More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf860 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf860  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
490 aa  1005    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0069  lysyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 
493 aa  529  1e-149  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
496 aa  503  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 
494 aa  502  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 
496 aa  497  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
494 aa  495  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 
495 aa  492  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
494 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
515 aa  490  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
515 aa  490  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0836  lysyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 
500 aa  478  1e-134  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
499 aa  479  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 
499 aa  475  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 
499 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 
495 aa  476  1e-133  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
499 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
499 aa  474  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
499 aa  474  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
499 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
499 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 
499 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
499 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl030  lysyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 
499 aa  466  9.999999999999999e-131  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 
499 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
495 aa  467  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
504 aa  462  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 
489 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
497 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0190  lysyl-tRNA synthetase (class II)  46.34 
 
 
496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 
503 aa  449  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 
489 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
501 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
501 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 
510 aa  438  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  45.44 
 
 
499 aa  433  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
492 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 
499 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
647 aa  432  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3370  lysyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
505 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234173  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
491 aa  432  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39390  lysyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
500 aa  428  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
511 aa  430  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  45.83 
 
 
491 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
489 aa  430  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
509 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
488 aa  429  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
493 aa  430  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
573 aa  425  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  45.19 
 
 
505 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
505 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4226  lysyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
500 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366371  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1496  lysyl-tRNA synthetase  45 
 
 
500 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
510 aa  425  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0450  lysyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
501 aa  427  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
505 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1501  lysyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
500 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0424  lysyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
501 aa  425  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0159622  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1132  lysyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
500 aa  425  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4121  lysyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
500 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1060  lysyl-tRNA synthetase  45 
 
 
499 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.175669  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
492 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
505 aa  425  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1217  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  44.79 
 
 
502 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00362482  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
573 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1101  lysyl-tRNA synthetase  45 
 
 
500 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  45.19 
 
 
505 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16530  lysyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
501 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.530256  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1456  lysyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
510 aa  426  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.370095  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
508 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
513 aa  425  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
505 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1556  lysyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
501 aa  425  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
508 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1311  lysyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
500 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 
524 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 
505 aa  425  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1438  lysyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
501 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
505 aa  425  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0600  lysyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
508 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834751  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
505 aa  425  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
492 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 
499 aa  424  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
508 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
509 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3050  lysyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
521 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1700  lysyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
508 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1450  lysyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 
512 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1480  lysyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
508 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 
505 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 
505 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
508 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 
505 aa  419  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2591  lysyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
508 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
505 aa  421  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 
508 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 
508 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
503 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
505 aa  421  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>