101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_04015 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03913  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.86 
 
 		 807 aa  725    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.818357  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3952  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  45.86 
 
 		 807 aa  725    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0133  glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.32 
 
 		 811 aa  676    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4602  glycerol-3-phosphate acyltransferase  47.13 
 
 		 809 aa  726    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3514  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.32 
 
 		 807 aa  744    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4248  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  61.53 
 
 		 811 aa  1084    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0385  glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.48 
 
 		 811 aa  685    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3788  glycerol-3-phosphate acyltransferase  47 
 
 		 807 aa  724    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3861  glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.74 
 
 		 807 aa  724    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.761394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0261  glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.6 
 
 		 807 aa  721    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3988  glycerol-3-phosphate acyltransferase  47.13 
 
 		 807 aa  726    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.740194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3480  glycerol-3-phosphate acyltransferase  47.58 
 
 		 807 aa  739    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0157  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.95 
 
 		 807 aa  717    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3530  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.07 
 
 		 807 aa  727    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0245  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.47 
 
 		 806 aa  719    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.659891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3779  glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.87 
 
 		 807 aa  723    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2422  glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.12 
 
 		 811 aa  695    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4177  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.82 
 
 		 807 aa  716    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3772  glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.17 
 
 		 825 aa  750    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00269  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45 
 
 		 790 aa  703    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4281  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.86 
 
 		 807 aa  725    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4594  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.86 
 
 		 807 aa  725    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503776  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0201  glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.12 
 
 		 807 aa  686    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4462  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.07 
 
 		 821 aa  731    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3996  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.75 
 
 		 807 aa  711    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4308  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.82 
 
 		 807 aa  716    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3862  glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.17 
 
 		 828 aa  750    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3987  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.86 
 
 		 807 aa  725    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.487396 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4503  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.86 
 
 		 827 aa  724    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0181  glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.72 
 
 		 807 aa  699    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4556  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.61 
 
 		 807 aa  721    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4578  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.61 
 
 		 806 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153091  normal  0.0823596 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4577  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.61 
 
 		 806 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4427  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.61 
 
 		 806 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000489511 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04015  glycerol-3-phosphate acyltransferase  100 
 
 		 818 aa  1698    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4492  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.61 
 
 		 806 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.32327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4629  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.61 
 
 		 806 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.201291 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2894  glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.43 
 
 		 807 aa  679    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5522  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.87 
 
 		 807 aa  723    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.222297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4109  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.7 
 
 		 807 aa  714    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3400  glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.73 
 
 		 827 aa  709    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.841404  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3526  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.23 
 
 		 825 aa  738    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0512  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.42 
 
 		 822 aa  728    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0731  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.42 
 
 		 822 aa  721    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.358742  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002147  glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.75 
 
 		 758 aa  667    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0020  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.96 
 
 		 821 aa  578  1.0000000000000001e-163  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16860  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.02 
 
 		 834 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00942746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1466  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.02 
 
 		 834 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.077287  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2228  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.61 
 
 		 823 aa  558  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1126  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.81 
 
 		 828 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.34599  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1520  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.87 
 
 		 828 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379419  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4203  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.45 
 
 		 828 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.328155 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3091  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.16 
 
 		 827 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1084  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.04 
 
 		 834 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1520  glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.59 
 
 		 833 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563875  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1328  glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.94 
 
 		 833 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0851055 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4098  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.12 
 
 		 828 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03607  glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.5 
 
 		 886 aa  496  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0861  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.15 
 
 		 838 aa  486  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0345  glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.04 
 
 		 863 aa  477  1e-133  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.327765  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0310  glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.21 
 
 		 863 aa  478  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0056  glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.95 
 
 		 878 aa  460  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753755 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0194  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  33.72 
 
 		 799 aa  437  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0145  glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.46 
 
 		 930 aa  395  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0134  glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.5 
 
 		 930 aa  392  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0908404  normal  0.57314 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0165  glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.28 
 
 		 944 aa  381  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.388092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1991  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  27.37 
 
 		 881 aa  256  9e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0003746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3097  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.8 
 
 		 887 aa  253  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2476  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  29.73 
 
 		 869 aa  231  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.930155  normal  0.326716 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2667  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  30.3 
 
 		 866 aa  224  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2571  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  30.12 
 
 		 866 aa  221  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1289  glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.22 
 
 		 867 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153054  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00206  acyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11030)  29.22 
 
 		 806 aa  162  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0934118  normal  0.404402 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4652  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.61 
 
 		 750 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2565  glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.1 
 
 		 783 aa  138  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.302237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4074  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.15 
 
 		 783 aa  135  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204075  normal  0.946576 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3618  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.12 
 
 		 790 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3691  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.12 
 
 		 790 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3623  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.12 
 
 		 790 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.910554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12503  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.25 
 
 		 789 aa  128  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0795  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.96 
 
 		 495 aa  119  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11583  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.43 
 
 		 621 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.665095 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0194  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.39 
 
 		 783 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5001  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.21 
 
 		 623 aa  111  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3105  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.33 
 
 		 476 aa  108  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.54 
 
 		 480 aa  107  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59314  predicted protein  35.84 
 
 		 811 aa  102  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44189  predicted protein  28.57 
 
 		 1560 aa  61.2  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0283  hypothetical protein  25.84 
 
 		 551 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3150  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.88 
 
 		 548 aa  55.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142438  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2141  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.97 
 
 		 309 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1140  hypothetical protein  26.29 
 
 		 387 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423166  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0797  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.77 
 
 		 388 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4433  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.59 
 
 		 389 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0783  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.77 
 
 		 388 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0756  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.77 
 
 		 423 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4719  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.71 
 
 		 388 aa  45.8  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.301329  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0980  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.36 
 
 		 388 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3672  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.11 
 
 		 387 aa  45.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41290  acyltransferase  29.29 
 
 		 388 aa  44.3  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>