46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_41290 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_41290  acyltransferase  100 
 
 
388 aa  792    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4719  phospholipid/glycerol acyltransferase  77.84 
 
 
388 aa  643    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.301329  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0756  phospholipid/glycerol acyltransferase  77.58 
 
 
423 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4433  phospholipid/glycerol acyltransferase  77.58 
 
 
389 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0783  phospholipid/glycerol acyltransferase  77.52 
 
 
388 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0797  phospholipid/glycerol acyltransferase  77.52 
 
 
388 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3672  phospholipid/glycerol acyltransferase  79.9 
 
 
387 aa  628  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0980  phospholipid/glycerol acyltransferase  76.29 
 
 
388 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101796  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61360  hypothetical protein  78.33 
 
 
386 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.528494 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1140  hypothetical protein  75.97 
 
 
387 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423166  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5284  hypothetical protein  77.55 
 
 
386 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2382  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  47.7 
 
 
387 aa  368  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679133 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0318  hypothetical protein  53.08 
 
 
372 aa  365  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0302237  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2170  phospholipid/glycerol acyltransferase  52.49 
 
 
392 aa  364  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001345  hypothetical protein  49.2 
 
 
369 aa  355  7.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0611  hypothetical protein  46.81 
 
 
367 aa  353  4e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.26573  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05234  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  48.66 
 
 
368 aa  351  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.89 
 
 
401 aa  346  4e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653304  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4244  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.11 
 
 
368 aa  333  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0569611  hitchhiker  0.00000000098519 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3186  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.26 
 
 
371 aa  333  3e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187487  normal  0.0571033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3117  hypothetical protein  43.08 
 
 
375 aa  305  6e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0728  hypothetical protein  38.58 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1279  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.25 
 
 
378 aa  226  6e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412644  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0264  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.18 
 
 
377 aa  207  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.173389  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3995  hypothetical protein  33.96 
 
 
378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0134  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.98 
 
 
930 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0908404  normal  0.57314 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0145  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.82 
 
 
930 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4248  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  27.43 
 
 
811 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03607  glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.11 
 
 
886 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4556  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.66 
 
 
807 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3952  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  24.66 
 
 
807 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5522  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.66 
 
 
807 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.222297  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04015  glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.29 
 
 
818 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4503  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.66 
 
 
827 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3987  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.66 
 
 
807 aa  44.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.487396 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4594  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.66 
 
 
807 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4281  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.66 
 
 
807 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03913  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.66 
 
 
807 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.818357  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4578  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.2 
 
 
806 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153091  normal  0.0823596 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4577  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.2 
 
 
806 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4427  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.2 
 
 
806 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000489511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4492  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.2 
 
 
806 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.32327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4629  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.2 
 
 
806 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.201291 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0245  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.2 
 
 
806 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.659891  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0731  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.55 
 
 
822 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.358742  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0165  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.13 
 
 
944 aa  43.1  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.388092  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>