47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0980 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0756  phospholipid/glycerol acyltransferase  82.51 
 
 		 423 aa  666    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4433  phospholipid/glycerol acyltransferase  83.29 
 
 		 389 aa  671    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1140  hypothetical protein  94.32 
 
 		 387 aa  762    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0980  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 		 388 aa  803    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4719  phospholipid/glycerol acyltransferase  86.08 
 
 		 388 aa  702    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.301329  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0797  phospholipid/glycerol acyltransferase  82.2 
 
 		 388 aa  662    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0783  phospholipid/glycerol acyltransferase  82.46 
 
 		 388 aa  665    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5284  hypothetical protein  75.98 
 
 		 386 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61360  hypothetical protein  75.46 
 
 		 386 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.528494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41290  acyltransferase  76.29 
 
 		 388 aa  608  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3672  phospholipid/glycerol acyltransferase  74.23 
 
 		 387 aa  588  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2382  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  44.94 
 
 		 387 aa  349  4e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679133 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0318  hypothetical protein  50.8 
 
 		 372 aa  349  4e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0302237  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2170  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.59 
 
 		 392 aa  338  8e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001345  hypothetical protein  48.66 
 
 		 369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05234  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  46.52 
 
 		 368 aa  333  4e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3186  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.74 
 
 		 371 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187487  normal  0.0571033 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4244  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.07 
 
 		 368 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0569611  hitchhiker  0.00000000098519 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0611  hypothetical protein  42.82 
 
 		 367 aa  317  3e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.26573  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.96 
 
 		 401 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3117  hypothetical protein  40.26 
 
 		 375 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0728  hypothetical protein  40.53 
 
 		 388 aa  231  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1279  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.98 
 
 		 378 aa  206  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412644  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0264  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.49 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.173389  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3995  hypothetical protein  33.23 
 
 		 378 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0385  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.17 
 
 		 811 aa  45.8  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0194  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  24.68 
 
 		 799 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04015  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.36 
 
 		 818 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4248  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  26.11 
 
 		 811 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03913  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.2 
 
 		 807 aa  43.5  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.818357  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3952  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  24.2 
 
 		 807 aa  43.5  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5522  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.2 
 
 		 807 aa  43.5  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.222297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3987  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.2 
 
 		 807 aa  43.5  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.487396 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4462  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.35 
 
 		 821 aa  43.5  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4594  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.2 
 
 		 807 aa  43.5  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4281  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.2 
 
 		 807 aa  43.5  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4556  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.2 
 
 		 807 aa  43.5  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4503  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.2 
 
 		 827 aa  43.5  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0245  glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.48 
 
 		 806 aa  43.5  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.659891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03607  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.69 
 
 		 886 aa  43.1  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4427  glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.74 
 
 		 806 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000489511 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2894  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.29 
 
 		 807 aa  43.1  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0345  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.97 
 
 		 863 aa  42.7  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.327765  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4578  glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.74 
 
 		 806 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153091  normal  0.0823596 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4577  glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.74 
 
 		 806 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4492  glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.74 
 
 		 806 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.32327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4629  glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.74 
 
 		 806 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.201291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>