27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3186 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3186  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
371 aa  768    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187487  normal  0.0571033 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0318  hypothetical protein  52.45 
 
 
372 aa  403  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0302237  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001345  hypothetical protein  52.99 
 
 
369 aa  394  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05234  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  51.38 
 
 
368 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4244  phospholipid/glycerol acyltransferase  50.27 
 
 
368 aa  368  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0569611  hitchhiker  0.00000000098519 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0611  hypothetical protein  48.48 
 
 
367 aa  364  1e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.26573  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5284  hypothetical protein  45.26 
 
 
386 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61360  hypothetical protein  44.47 
 
 
386 aa  329  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.528494 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2170  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.97 
 
 
392 aa  328  9e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41290  acyltransferase  45 
 
 
388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.41 
 
 
401 aa  322  7e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2382  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  44.3 
 
 
387 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0980  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.74 
 
 
388 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101796  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1140  hypothetical protein  44.21 
 
 
387 aa  319  5e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3672  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.95 
 
 
387 aa  315  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3117  hypothetical protein  43.97 
 
 
375 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0797  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.12 
 
 
388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4433  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.86 
 
 
389 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4719  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.63 
 
 
388 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.301329  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0783  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.86 
 
 
388 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0756  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.86 
 
 
423 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0264  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.92 
 
 
377 aa  218  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.173389  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1279  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.72 
 
 
378 aa  210  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412644  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0728  hypothetical protein  33.76 
 
 
388 aa  199  9e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3995  hypothetical protein  35.39 
 
 
378 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3072  1-acyl-glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsC  23.04 
 
 
229 aa  43.1  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.024728 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03607  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.43 
 
 
886 aa  43.1  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>