26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0728 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0728  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  808    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41290  acyltransferase  38.32 
 
 
388 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0264  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.84 
 
 
377 aa  239  5e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.173389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5284  hypothetical protein  37.63 
 
 
386 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0783  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.41 
 
 
388 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1279  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.04 
 
 
378 aa  236  7e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412644  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0756  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.75 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0797  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.64 
 
 
388 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61360  hypothetical protein  38.07 
 
 
386 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.528494 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0980  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.53 
 
 
388 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101796  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4719  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.4 
 
 
388 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.301329  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4433  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.31 
 
 
389 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1140  hypothetical protein  37.12 
 
 
387 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3672  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.48 
 
 
387 aa  223  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.16 
 
 
401 aa  206  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653304  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001345  hypothetical protein  38.1 
 
 
369 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2170  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.35 
 
 
392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05234  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  36.01 
 
 
368 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3186  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.76 
 
 
371 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187487  normal  0.0571033 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0318  hypothetical protein  36.09 
 
 
372 aa  196  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0302237  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2382  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  36.42 
 
 
387 aa  196  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679133 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0611  hypothetical protein  34.46 
 
 
367 aa  193  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.26573  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3117  hypothetical protein  34.37 
 
 
375 aa  192  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4244  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.73 
 
 
368 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0569611  hitchhiker  0.00000000098519 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3995  hypothetical protein  29.18 
 
 
378 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0165  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.6 
 
 
944 aa  43.9  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.388092  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>