28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001345 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001345  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  762    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05234  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  90.24 
 
 
368 aa  700    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0318  hypothetical protein  75.82 
 
 
372 aa  586  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0302237  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0611  hypothetical protein  62.36 
 
 
367 aa  468  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.26573  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3186  phospholipid/glycerol acyltransferase  52.99 
 
 
371 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187487  normal  0.0571033 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4244  phospholipid/glycerol acyltransferase  50.27 
 
 
368 aa  361  9e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0569611  hitchhiker  0.00000000098519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41290  acyltransferase  48.93 
 
 
388 aa  352  4e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5284  hypothetical protein  47.59 
 
 
386 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61360  hypothetical protein  47.06 
 
 
386 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.528494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0783  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.79 
 
 
388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4433  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.52 
 
 
389 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0756  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.52 
 
 
423 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0980  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.66 
 
 
388 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101796  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1140  hypothetical protein  47.86 
 
 
387 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423166  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0797  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.81 
 
 
388 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2170  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.09 
 
 
392 aa  328  6e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4719  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.52 
 
 
388 aa  328  9e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.301329  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.33 
 
 
401 aa  323  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2382  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  44.62 
 
 
387 aa  312  5.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679133 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3672  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.05 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3117  hypothetical protein  42.82 
 
 
375 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1279  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.13 
 
 
378 aa  216  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412644  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0728  hypothetical protein  38.1 
 
 
388 aa  203  3e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0264  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.29 
 
 
377 aa  191  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.173389  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3995  hypothetical protein  35.16 
 
 
378 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04015  glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.18 
 
 
818 aa  44.3  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3772  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.46 
 
 
825 aa  42.7  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3862  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.46 
 
 
828 aa  42.7  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>