25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0264 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0264  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
377 aa  785    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.173389  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1279  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.65 
 
 
378 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412644  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0728  hypothetical protein  34.84 
 
 
388 aa  239  5e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3186  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.92 
 
 
371 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187487  normal  0.0571033 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0611  hypothetical protein  35.94 
 
 
367 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.26573  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61360  hypothetical protein  33.33 
 
 
386 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.528494 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2382  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  32.75 
 
 
387 aa  206  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679133 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3672  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.35 
 
 
387 aa  206  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3117  hypothetical protein  32.65 
 
 
375 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41290  acyltransferase  34.18 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5284  hypothetical protein  33.33 
 
 
386 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1140  hypothetical protein  33.08 
 
 
387 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2170  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.5 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0980  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.49 
 
 
388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101796  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0318  hypothetical protein  33.42 
 
 
372 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0302237  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4719  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.98 
 
 
388 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.301329  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4433  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.41 
 
 
389 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0797  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.98 
 
 
388 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001345  hypothetical protein  34.29 
 
 
369 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0783  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.98 
 
 
388 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0756  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.91 
 
 
423 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05234  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  34.64 
 
 
368 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.25 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653304  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4244  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.29 
 
 
368 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0569611  hitchhiker  0.00000000098519 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3995  hypothetical protein  26.33 
 
 
378 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>