28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3995 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3995  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  786    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0318  hypothetical protein  37.13 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0302237  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3117  hypothetical protein  33.88 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3186  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.39 
 
 		 371 aa  184  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187487  normal  0.0571033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61360  hypothetical protein  34.8 
 
 		 386 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.528494 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001345  hypothetical protein  35.16 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5284  hypothetical protein  33.53 
 
 		 386 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1279  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.77 
 
 		 378 aa  177  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412644  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3672  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05234  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  37.4 
 
 		 368 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41290  acyltransferase  33.86 
 
 		 388 aa  173  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4244  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.89 
 
 		 368 aa  172  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0569611  hitchhiker  0.00000000098519 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0611  hypothetical protein  32.57 
 
 		 367 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.26573  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1140  hypothetical protein  33.64 
 
 		 387 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0980  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.23 
 
 		 388 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2170  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.51 
 
 		 392 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0728  hypothetical protein  29.18 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0797  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.83 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4433  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.7 
 
 		 389 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0756  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.09 
 
 		 423 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0783  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.09 
 
 		 388 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.93 
 
 		 401 aa  162  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653304  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4719  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.55 
 
 		 388 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.301329  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2382  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  33.04 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679133 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0264  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.33 
 
 		 377 aa  129  6e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.173389  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0861  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25 
 
 		 838 aa  51.2  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0989  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.33 
 
 		 247 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000595038  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1141  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.33 
 
 		 247 aa  44.3  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00382889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>