29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0318 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0318  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  775    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0302237  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05234  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  76.02 
 
 
368 aa  592  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001345  hypothetical protein  75.82 
 
 
369 aa  586  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0611  hypothetical protein  60.99 
 
 
367 aa  459  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.26573  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3186  phospholipid/glycerol acyltransferase  52.45 
 
 
371 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187487  normal  0.0571033 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4244  phospholipid/glycerol acyltransferase  52.07 
 
 
368 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0569611  hitchhiker  0.00000000098519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41290  acyltransferase  52.82 
 
 
388 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1140  hypothetical protein  51.34 
 
 
387 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0980  phospholipid/glycerol acyltransferase  50.8 
 
 
388 aa  349  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101796  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4719  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.2 
 
 
388 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.301329  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0756  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.93 
 
 
423 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0783  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.93 
 
 
388 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4433  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.66 
 
 
389 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0797  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.73 
 
 
388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2170  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.38 
 
 
392 aa  335  7e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61360  hypothetical protein  48.4 
 
 
386 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.528494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5284  hypothetical protein  48.66 
 
 
386 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3672  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.13 
 
 
387 aa  324  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2382  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  43.97 
 
 
387 aa  308  6.999999999999999e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679133 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3117  hypothetical protein  43.9 
 
 
375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.01 
 
 
401 aa  302  6.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1279  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.36 
 
 
378 aa  199  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412644  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0264  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.42 
 
 
377 aa  197  4.0000000000000005e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.173389  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0728  hypothetical protein  36.09 
 
 
388 aa  196  6e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3995  hypothetical protein  37.13 
 
 
378 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3097  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.8 
 
 
887 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03607  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.89 
 
 
886 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0020  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.14 
 
 
821 aa  44.3  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0169  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.61 
 
 
625 aa  43.1  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>