36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2382 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2382  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  100 
 
 		 387 aa  804    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679133 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41290  acyltransferase  47.53 
 
 		 388 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4719  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.49 
 
 		 388 aa  355  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.301329  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5284  hypothetical protein  47.07 
 
 		 386 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61360  hypothetical protein  47.07 
 
 		 386 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.528494 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0980  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.94 
 
 		 388 aa  349  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0783  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.28 
 
 		 388 aa  348  6e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0756  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.28 
 
 		 423 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0797  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.28 
 
 		 388 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4433  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.01 
 
 		 389 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1140  hypothetical protein  44.68 
 
 		 387 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3672  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.23 
 
 		 387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.24 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653304  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2170  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.62 
 
 		 392 aa  332  9e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3117  hypothetical protein  43.24 
 
 		 375 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3186  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.3 
 
 		 371 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187487  normal  0.0571033 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001345  hypothetical protein  44.62 
 
 		 369 aa  312  5.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0318  hypothetical protein  43.97 
 
 		 372 aa  308  6.999999999999999e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0302237  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05234  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  48.58 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0611  hypothetical protein  47.34 
 
 		 367 aa  304  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.26573  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4244  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.64 
 
 		 368 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0569611  hitchhiker  0.00000000098519 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0264  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.75 
 
 		 377 aa  206  7e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.173389  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1279  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.16 
 
 		 378 aa  199  9e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412644  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0728  hypothetical protein  36.42 
 
 		 388 aa  196  8.000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3995  hypothetical protein  33.04 
 
 		 378 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1520  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.39 
 
 		 833 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563875  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1084  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.93 
 
 		 834 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4098  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.64 
 
 		 828 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1520  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.94 
 
 		 828 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379419  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1126  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.94 
 
 		 828 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.34599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4203  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.94 
 
 		 828 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.328155 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3091  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.12 
 
 		 827 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2228  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.88 
 
 		 823 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1466  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.91 
 
 		 834 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.077287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16860  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.91 
 
 		 834 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00942746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1328  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.46 
 
 		 833 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0851055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>