91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1328 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03607  glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.64 
 
 		 886 aa  639    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16860  glycerol-3-phosphate acyltransferase  78.28 
 
 		 834 aa  1340    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00942746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2228  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.71 
 
 		 823 aa  798    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1466  glycerol-3-phosphate acyltransferase  78.16 
 
 		 834 aa  1340    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.077287  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4098  glycerol-3-phosphate acyltransferase  81.54 
 
 		 828 aa  1361    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1084  glycerol-3-phosphate acyltransferase  85.82 
 
 		 834 aa  1488    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3091  glycerol-3-phosphate acyltransferase  83.11 
 
 		 827 aa  1434    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1520  glycerol-3-phosphate acyltransferase  95.08 
 
 		 833 aa  1630    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563875  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1520  glycerol-3-phosphate acyltransferase  80.02 
 
 		 828 aa  1366    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379419  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1126  glycerol-3-phosphate acyltransferase  79.9 
 
 		 828 aa  1366    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.34599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4203  glycerol-3-phosphate acyltransferase  79.78 
 
 		 828 aa  1362    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.328155 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1328  glycerol-3-phosphate acyltransferase  100 
 
 		 833 aa  1702    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0851055 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0861  glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.98 
 
 		 838 aa  625  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0345  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.73 
 
 		 863 aa  624  1e-177  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.327765  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0310  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.48 
 
 		 863 aa  622  1e-177  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0056  glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.27 
 
 		 878 aa  619  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753755 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4248  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  39.54 
 
 		 811 aa  591  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3526  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.69 
 
 		 825 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3530  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.67 
 
 		 807 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3779  glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.24 
 
 		 807 aa  568  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2894  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.84 
 
 		 807 aa  566  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3788  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.6 
 
 		 807 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0157  glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.49 
 
 		 807 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4177  glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.49 
 
 		 807 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3861  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.6 
 
 		 807 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.761394  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4602  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.73 
 
 		 809 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3514  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.41 
 
 		 807 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3400  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.9 
 
 		 827 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.841404  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4308  glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.49 
 
 		 807 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3988  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.47 
 
 		 807 aa  560  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.740194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2422  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.92 
 
 		 811 aa  560  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4109  glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.45 
 
 		 807 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0261  glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.17 
 
 		 807 aa  555  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3480  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.93 
 
 		 807 aa  551  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4462  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.66 
 
 		 821 aa  549  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3772  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.62 
 
 		 825 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4427  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.35 
 
 		 806 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000489511 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3862  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.62 
 
 		 828 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0245  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.47 
 
 		 806 aa  547  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.659891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3987  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.45 
 
 		 807 aa  545  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.487396 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4503  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.52 
 
 		 827 aa  543  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3996  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.05 
 
 		 807 aa  544  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4594  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.45 
 
 		 807 aa  545  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503776  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4577  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.35 
 
 		 806 aa  545  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4281  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.45 
 
 		 807 aa  545  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4578  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.35 
 
 		 806 aa  545  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153091  normal  0.0823596 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03913  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.45 
 
 		 807 aa  545  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.818357  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3952  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  38.45 
 
 		 807 aa  545  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5522  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.45 
 
 		 807 aa  543  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.222297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4629  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.35 
 
 		 806 aa  545  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.201291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4492  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.35 
 
 		 806 aa  545  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.32327  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4556  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.21 
 
 		 807 aa  545  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0145  glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.39 
 
 		 930 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0512  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.63 
 
 		 822 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04015  glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.94 
 
 		 818 aa  536  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0385  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.59 
 
 		 811 aa  534  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0201  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.59 
 
 		 807 aa  533  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0181  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.8 
 
 		 807 aa  535  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0134  glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.31 
 
 		 930 aa  535  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0908404  normal  0.57314 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0731  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.97 
 
 		 822 aa  535  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.358742  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00269  glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.77 
 
 		 790 aa  525  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002147  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.7 
 
 		 758 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0133  glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.9 
 
 		 811 aa  492  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0165  glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.5 
 
 		 944 aa  480  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.388092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0020  glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.49 
 
 		 821 aa  429  1e-119  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0194  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  30.79 
 
 		 799 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1991  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  31.73 
 
 		 881 aa  280  7e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0003746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3097  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.39 
 
 		 887 aa  256  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2571  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  29.82 
 
 		 866 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2667  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  29.64 
 
 		 866 aa  224  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1289  glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.29 
 
 		 867 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153054  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2476  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  29.69 
 
 		 869 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.930155  normal  0.326716 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00206  acyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11030)  32.71 
 
 		 806 aa  160  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0934118  normal  0.404402 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4652  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.06 
 
 		 750 aa  130  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4074  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.3 
 
 		 783 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204075  normal  0.946576 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3618  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.72 
 
 		 790 aa  127  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3691  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.72 
 
 		 790 aa  127  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3623  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.72 
 
 		 790 aa  127  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.910554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12503  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.43 
 
 		 789 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59314  predicted protein  25.46 
 
 		 811 aa  123  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2565  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.82 
 
 		 783 aa  119  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.302237 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0795  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.42 
 
 		 495 aa  115  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.72 
 
 		 480 aa  114  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0194  glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.51 
 
 		 783 aa  100  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5001  glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.87 
 
 		 623 aa  97.8  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11583  glycerol-3-phosphate acyltransferase  22.49 
 
 		 621 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.665095 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3105  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.64 
 
 		 476 aa  95.1  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44189  predicted protein  30.7 
 
 		 1560 aa  70.5  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3150  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.12 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142438  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0283  hypothetical protein  26.7 
 
 		 551 aa  55.1  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2382  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  25.46 
 
 		 387 aa  45.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>