102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4248 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03913  glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.06 
 
 		 807 aa  729    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.818357  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3952  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  46.06 
 
 		 807 aa  729    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0133  glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.89 
 
 		 811 aa  671    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4602  glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.14 
 
 		 809 aa  755    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002147  glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.72 
 
 		 758 aa  661    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3514  glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.89 
 
 		 807 aa  763    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4248  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  100 
 
 		 811 aa  1675    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0385  glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.6 
 
 		 811 aa  680    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3788  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.29 
 
 		 807 aa  749    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3861  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.55 
 
 		 807 aa  750    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.761394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0261  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.48 
 
 		 807 aa  748    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3988  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.29 
 
 		 807 aa  749    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.740194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3480  glycerol-3-phosphate acyltransferase  47.97 
 
 		 807 aa  746    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0157  glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.34 
 
 		 807 aa  746    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3530  glycerol-3-phosphate acyltransferase  47.63 
 
 		 807 aa  750    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0245  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.35 
 
 		 806 aa  720    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.659891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3779  glycerol-3-phosphate acyltransferase  47.3 
 
 		 807 aa  749    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2422  glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.78 
 
 		 811 aa  701    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4177  glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.21 
 
 		 807 aa  745    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3772  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.32 
 
 		 825 aa  717    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00269  glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.45 
 
 		 790 aa  694    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4281  glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.06 
 
 		 807 aa  729    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4594  glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.06 
 
 		 807 aa  729    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503776  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0201  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.1 
 
 		 807 aa  726    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4462  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.98 
 
 		 821 aa  719    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3996  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.55 
 
 		 807 aa  744    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4308  glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.21 
 
 		 807 aa  745    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3862  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.32 
 
 		 828 aa  717    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3987  glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.06 
 
 		 807 aa  729    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.487396 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4503  glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.06 
 
 		 827 aa  729    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0181  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.03 
 
 		 807 aa  732    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4556  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.81 
 
 		 807 aa  726    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4578  glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.24 
 
 		 806 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153091  normal  0.0823596 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4577  glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.24 
 
 		 806 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4427  glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.37 
 
 		 806 aa  718    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000489511 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04015  glycerol-3-phosphate acyltransferase  61.53 
 
 		 818 aa  1084    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4492  glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.24 
 
 		 806 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.32327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4629  glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.24 
 
 		 806 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.201291 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2894  glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.22 
 
 		 807 aa  691    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5522  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.94 
 
 		 807 aa  728    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.222297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4109  glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.21 
 
 		 807 aa  744    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3400  glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.83 
 
 		 827 aa  718    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.841404  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3526  glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.39 
 
 		 825 aa  740    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0512  glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.87 
 
 		 822 aa  725    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0731  glycerol-3-phosphate acyltransferase  47 
 
 		 822 aa  723    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.358742  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16860  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.46 
 
 		 834 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00942746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3091  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.53 
 
 		 827 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1466  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.58 
 
 		 834 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.077287  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1520  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.99 
 
 		 828 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379419  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1084  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.05 
 
 		 834 aa  594  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4203  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.11 
 
 		 828 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.328155 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1328  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.54 
 
 		 833 aa  591  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0851055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1126  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.87 
 
 		 828 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.34599  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1520  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.29 
 
 		 833 aa  585  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563875  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4098  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.15 
 
 		 828 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0020  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.68 
 
 		 821 aa  572  1.0000000000000001e-162  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2228  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.85 
 
 		 823 aa  551  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03607  glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.99 
 
 		 886 aa  509  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0861  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.91 
 
 		 838 aa  496  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0345  glycerol-3-phosphate acyltransferase  36 
 
 		 863 aa  490  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.327765  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0310  glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.18 
 
 		 863 aa  490  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0056  glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.69 
 
 		 878 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753755 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0194  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  35.39 
 
 		 799 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0134  glycerol-3-phosphate acyltransferase  32 
 
 		 930 aa  421  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0908404  normal  0.57314 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0145  glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.76 
 
 		 930 aa  415  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0165  glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.12 
 
 		 944 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.388092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1991  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  29.62 
 
 		 881 aa  261  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0003746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3097  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.76 
 
 		 887 aa  253  9.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2667  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  28.17 
 
 		 866 aa  223  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2571  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  28.04 
 
 		 866 aa  221  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1289  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.12 
 
 		 867 aa  220  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153054  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2476  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  28.94 
 
 		 869 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.930155  normal  0.326716 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00206  acyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11030)  25.62 
 
 		 806 aa  160  7e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0934118  normal  0.404402 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4652  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.19 
 
 		 750 aa  148  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3618  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.52 
 
 		 790 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3691  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.52 
 
 		 790 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3623  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.52 
 
 		 790 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.910554 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0795  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.71 
 
 		 495 aa  132  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2565  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.86 
 
 		 783 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.302237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12503  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.68 
 
 		 789 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4074  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.52 
 
 		 783 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204075  normal  0.946576 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3105  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.23 
 
 		 476 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11583  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.89 
 
 		 621 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.665095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5001  glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.74 
 
 		 623 aa  110  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0194  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.83 
 
 		 783 aa  108  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59314  predicted protein  34.91 
 
 		 811 aa  102  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.41 
 
 		 480 aa  101  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3150  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.86 
 
 		 548 aa  65.1  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142438  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44189  predicted protein  28.07 
 
 		 1560 aa  58.9  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0283  hypothetical protein  31.68 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2141  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.65 
 
 		 309 aa  47.8  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4433  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.27 
 
 		 389 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  26.5 
 
 		 812 aa  47.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0783  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.39 
 
 		 388 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0797  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.39 
 
 		 388 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0756  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.39 
 
 		 423 aa  45.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3672  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.05 
 
 		 387 aa  45.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41290  acyltransferase  27.43 
 
 		 388 aa  45.4  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1473  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.5 
 
 		 281 aa  45.1  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0297891  normal  0.0549508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1140  hypothetical protein  25.77 
 
 		 387 aa  44.3  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>