96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1991 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1991  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  100 
 
 
881 aa  1822    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0003746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3097  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.65 
 
 
887 aa  525  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2476  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  30.59 
 
 
869 aa  365  2e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.930155  normal  0.326716 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2571  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  30.64 
 
 
866 aa  353  5e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2667  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  30.5 
 
 
866 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1289  glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.18 
 
 
867 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153054  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1520  glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.4 
 
 
828 aa  290  9e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379419  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4203  glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.23 
 
 
828 aa  289  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.328155 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1328  glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.73 
 
 
833 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0851055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1084  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.92 
 
 
834 aa  286  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0861  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.85 
 
 
838 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2228  glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.71 
 
 
823 aa  285  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1126  glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.05 
 
 
828 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.34599  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1520  glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.92 
 
 
833 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563875  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3772  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.16 
 
 
825 aa  283  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16860  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.83 
 
 
834 aa  283  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00942746  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1466  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.83 
 
 
834 aa  283  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.077287  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3091  glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.12 
 
 
827 aa  283  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191573  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3862  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.16 
 
 
828 aa  283  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3514  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.82 
 
 
807 aa  282  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00269  glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.03 
 
 
790 aa  281  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4098  glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.64 
 
 
828 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227431  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3526  glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.69 
 
 
825 aa  280  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4462  glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.58 
 
 
821 aa  279  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4503  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.51 
 
 
827 aa  277  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4556  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.54 
 
 
807 aa  277  8e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4594  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.54 
 
 
807 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503776  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0245  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.46 
 
 
806 aa  276  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.659891  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03913  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.54 
 
 
807 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.818357  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3952  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  27.54 
 
 
807 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4281  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.54 
 
 
807 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3987  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.54 
 
 
807 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.487396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5522  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.54 
 
 
807 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.222297  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3861  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.99 
 
 
807 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.761394  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3788  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.85 
 
 
807 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3530  glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.12 
 
 
807 aa  275  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225343  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3400  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.66 
 
 
827 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.841404  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0512  glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.05 
 
 
822 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3988  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.7 
 
 
807 aa  273  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.740194  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3779  glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.14 
 
 
807 aa  273  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3996  glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.53 
 
 
807 aa  272  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002147  glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.01 
 
 
758 aa  272  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2422  glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.93 
 
 
811 aa  272  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4577  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.01 
 
 
806 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4578  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.01 
 
 
806 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153091  normal  0.0823596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4492  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.01 
 
 
806 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.32327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4629  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.01 
 
 
806 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.201291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4308  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.65 
 
 
807 aa  271  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4427  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.01 
 
 
806 aa  271  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000489511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0157  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.65 
 
 
807 aa  271  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4177  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.65 
 
 
807 aa  271  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4109  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.65 
 
 
807 aa  271  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4602  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.83 
 
 
809 aa  271  5.9999999999999995e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0731  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.64 
 
 
822 aa  270  7e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.358742  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3480  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.73 
 
 
807 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4248  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  29.62 
 
 
811 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2894  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.09 
 
 
807 aa  267  5e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0261  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.82 
 
 
807 aa  266  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0201  glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.17 
 
 
807 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04015  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.37 
 
 
818 aa  263  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0385  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.09 
 
 
811 aa  262  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03607  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.36 
 
 
886 aa  259  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0181  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.62 
 
 
807 aa  256  9e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0345  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.36 
 
 
863 aa  248  3e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.327765  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0310  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.92 
 
 
863 aa  248  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0020  glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.54 
 
 
821 aa  246  9.999999999999999e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0133  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.97 
 
 
811 aa  244  5e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0194  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  29.15 
 
 
799 aa  243  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0056  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.03 
 
 
878 aa  239  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.753755 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0145  glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.72 
 
 
930 aa  230  7e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0134  glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.27 
 
 
930 aa  228  3e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0908404  normal  0.57314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3618  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.79 
 
 
790 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3691  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.79 
 
 
790 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103216  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3623  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.79 
 
 
790 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.910554 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0165  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.12 
 
 
944 aa  218  5e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.388092  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2565  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.46 
 
 
783 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.302237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4074  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.78 
 
 
783 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204075  normal  0.946576 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00206  acyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11030)  26.52 
 
 
806 aa  191  7e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0934118  normal  0.404402 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4652  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.54 
 
 
750 aa  182  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12503  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.95 
 
 
789 aa  181  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5001  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.05 
 
 
623 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0194  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.4 
 
 
783 aa  174  7.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11583  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.33 
 
 
621 aa  159  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.665095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0795  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.62 
 
 
495 aa  140  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3105  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.78 
 
 
476 aa  127  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59314  predicted protein  31.07 
 
 
811 aa  115  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.57 
 
 
480 aa  115  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3150  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.63 
 
 
548 aa  67.8  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142438  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44189  predicted protein  25.35 
 
 
1560 aa  59.3  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0283  hypothetical protein  25.35 
 
 
551 aa  51.2  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43099  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.9 
 
 
399 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0695  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.15 
 
 
262 aa  45.8  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11916  predicted protein  35.04 
 
 
144 aa  45.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09551  phospholipid and glycerol acyltransferase  26.29 
 
 
245 aa  45.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.364873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2141  phospholipid/glycerol acyltransferase  25 
 
 
309 aa  45.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1429  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.49 
 
 
303 aa  44.3  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.565196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>