88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3618 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3618  glycerol-3-phosphate acyltransferase  100 
 
 
790 aa  1600    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3691  glycerol-3-phosphate acyltransferase  100 
 
 
790 aa  1600    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103216  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4074  glycerol-3-phosphate acyltransferase  74.49 
 
 
783 aa  1197    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204075  normal  0.946576 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3623  glycerol-3-phosphate acyltransferase  100 
 
 
790 aa  1600    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.910554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2565  glycerol-3-phosphate acyltransferase  74.45 
 
 
783 aa  1179    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.302237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12503  glycerol-3-phosphate acyltransferase  68.14 
 
 
789 aa  1063    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4652  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.78 
 
 
750 aa  357  5.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0194  glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.63 
 
 
783 aa  331  4e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5001  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.52 
 
 
623 aa  297  4e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11583  glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.28 
 
 
621 aa  260  7e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.665095 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1991  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  29.18 
 
 
881 aa  210  7e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0003746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2571  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  29.46 
 
 
866 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2667  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  29.46 
 
 
866 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2476  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  29.02 
 
 
869 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.930155  normal  0.326716 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1289  glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.08 
 
 
867 aa  181  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153054  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3097  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.61 
 
 
887 aa  172  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4203  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.64 
 
 
828 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.328155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1520  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.64 
 
 
828 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379419  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002147  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.04 
 
 
758 aa  152  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1084  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.89 
 
 
834 aa  151  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00206  acyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11030)  29.17 
 
 
806 aa  147  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0934118  normal  0.404402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4098  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.44 
 
 
828 aa  148  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227431  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0194  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  27.7 
 
 
799 aa  147  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1126  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.82 
 
 
828 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.34599  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0385  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.07 
 
 
811 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2422  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.67 
 
 
811 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3996  glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.61 
 
 
807 aa  140  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03607  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.86 
 
 
886 aa  140  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00269  glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.88 
 
 
790 aa  139  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2894  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.02 
 
 
807 aa  139  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4602  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.19 
 
 
809 aa  138  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3514  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.54 
 
 
807 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3788  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.19 
 
 
807 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3530  glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.71 
 
 
807 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225343  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3772  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.17 
 
 
825 aa  137  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3861  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.19 
 
 
807 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.761394  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3862  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.17 
 
 
828 aa  137  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3779  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.97 
 
 
807 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3400  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.12 
 
 
827 aa  136  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.841404  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3988  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.19 
 
 
807 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.740194  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0261  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.12 
 
 
807 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3526  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.51 
 
 
825 aa  134  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3480  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.87 
 
 
807 aa  134  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4248  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  24.52 
 
 
811 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04015  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.12 
 
 
818 aa  134  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0056  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.46 
 
 
878 aa  133  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.753755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3091  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.83 
 
 
827 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191573  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4427  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.5 
 
 
806 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000489511 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4577  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.5 
 
 
806 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0731  glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.38 
 
 
822 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.358742  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4578  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.5 
 
 
806 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153091  normal  0.0823596 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0345  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.57 
 
 
863 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.327765  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4492  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.5 
 
 
806 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.32327  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1520  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.32 
 
 
833 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563875  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4629  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.5 
 
 
806 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.201291 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0310  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25 
 
 
863 aa  132  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1466  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.14 
 
 
834 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.077287  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4462  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.26 
 
 
821 aa  131  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3987  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.09 
 
 
807 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.487396 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0181  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.56 
 
 
807 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4594  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.09 
 
 
807 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4281  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.09 
 
 
807 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3952  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  28.09 
 
 
807 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03913  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.09 
 
 
807 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.818357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16860  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.52 
 
 
834 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00942746  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5522  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.09 
 
 
807 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.222297  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4503  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.12 
 
 
827 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4556  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.09 
 
 
807 aa  130  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2228  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.76 
 
 
823 aa  130  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0512  glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.08 
 
 
822 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0157  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.22 
 
 
807 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4177  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.22 
 
 
807 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4308  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.22 
 
 
807 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4109  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.22 
 
 
807 aa  129  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0201  glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.06 
 
 
807 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0245  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.86 
 
 
806 aa  128  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.659891  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1328  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.72 
 
 
833 aa  127  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0851055 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0133  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.98 
 
 
811 aa  127  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0861  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.78 
 
 
838 aa  117  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0165  glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.68 
 
 
944 aa  108  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.388092  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0020  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.17 
 
 
821 aa  103  9e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0145  glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.51 
 
 
930 aa  98.6  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0134  glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.51 
 
 
930 aa  98.2  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0908404  normal  0.57314 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59314  predicted protein  20.9 
 
 
811 aa  89.4  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0795  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.8 
 
 
495 aa  67  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.08 
 
 
480 aa  57.4  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3105  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.87 
 
 
476 aa  52.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3150  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.94 
 
 
548 aa  52  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142438  normal  0.328506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>