91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4462 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00269  glycerol-3-phosphate acyltransferase  58.31 
 
 
790 aa  956    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3987  glycerol-3-phosphate acyltransferase  81.44 
 
 
807 aa  1337    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.487396 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3862  glycerol-3-phosphate acyltransferase  90.22 
 
 
828 aa  1477    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4308  glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.37 
 
 
807 aa  756    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3996  glycerol-3-phosphate acyltransferase  50.19 
 
 
807 aa  762    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4462  glycerol-3-phosphate acyltransferase  100 
 
 
821 aa  1688    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0201  glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.81 
 
 
807 aa  741    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4594  glycerol-3-phosphate acyltransferase  81.44 
 
 
807 aa  1337    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4281  glycerol-3-phosphate acyltransferase  81.44 
 
 
807 aa  1337    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4503  glycerol-3-phosphate acyltransferase  81.32 
 
 
827 aa  1334    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3772  glycerol-3-phosphate acyltransferase  90.22 
 
 
825 aa  1477    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4177  glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.37 
 
 
807 aa  756    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2422  glycerol-3-phosphate acyltransferase  56.55 
 
 
811 aa  944    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3779  glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.37 
 
 
807 aa  765    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0245  glycerol-3-phosphate acyltransferase  81.57 
 
 
806 aa  1338    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.659891  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3530  glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.45 
 
 
807 aa  782    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225343  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0157  glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.37 
 
 
807 aa  757    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4629  glycerol-3-phosphate acyltransferase  80.7 
 
 
806 aa  1325    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.201291 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002147  glycerol-3-phosphate acyltransferase  58.34 
 
 
758 aa  911    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0731  glycerol-3-phosphate acyltransferase  81.51 
 
 
822 aa  1362    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.358742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0512  glycerol-3-phosphate acyltransferase  82.44 
 
 
822 aa  1368    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3526  glycerol-3-phosphate acyltransferase  80.56 
 
 
825 aa  1369    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3400  glycerol-3-phosphate acyltransferase  80.95 
 
 
827 aa  1380    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.841404  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4109  glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.25 
 
 
807 aa  754    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5522  glycerol-3-phosphate acyltransferase  81.32 
 
 
807 aa  1335    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.222297  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2894  glycerol-3-phosphate acyltransferase  59.73 
 
 
807 aa  994    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03913  glycerol-3-phosphate acyltransferase  81.44 
 
 
807 aa  1337    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.818357  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4492  glycerol-3-phosphate acyltransferase  80.7 
 
 
806 aa  1325    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.32327  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04015  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.07 
 
 
818 aa  755    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4427  glycerol-3-phosphate acyltransferase  80.7 
 
 
806 aa  1325    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000489511 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4577  glycerol-3-phosphate acyltransferase  80.7 
 
 
806 aa  1325    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4578  glycerol-3-phosphate acyltransferase  80.7 
 
 
806 aa  1325    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153091  normal  0.0823596 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4556  glycerol-3-phosphate acyltransferase  81.07 
 
 
807 aa  1330    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0181  glycerol-3-phosphate acyltransferase  50.13 
 
 
807 aa  750    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0020  glycerol-3-phosphate acyltransferase  54 
 
 
821 aa  893    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4248  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  45.64 
 
 
811 aa  740    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3514  glycerol-3-phosphate acyltransferase  50.71 
 
 
807 aa  794    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3952  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  81.44 
 
 
807 aa  1337    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0385  glycerol-3-phosphate acyltransferase  57.66 
 
 
811 aa  969    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3788  glycerol-3-phosphate acyltransferase  50.32 
 
 
807 aa  763    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3861  glycerol-3-phosphate acyltransferase  50.58 
 
 
807 aa  767    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.761394  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0261  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.75 
 
 
807 aa  764    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0133  glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.36 
 
 
811 aa  692    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4602  glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.12 
 
 
809 aa  764    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3988  glycerol-3-phosphate acyltransferase  50.32 
 
 
807 aa  764    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.740194  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3480  glycerol-3-phosphate acyltransferase  51.34 
 
 
807 aa  769    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3091  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.14 
 
 
827 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191573  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1466  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.97 
 
 
834 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.077287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16860  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.97 
 
 
834 aa  572  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00942746  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1328  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.66 
 
 
833 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0851055 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2228  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.81 
 
 
823 aa  568  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1084  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.23 
 
 
834 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1520  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.33 
 
 
833 aa  561  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563875  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1126  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.9 
 
 
828 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.34599  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4203  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.66 
 
 
828 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.328155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1520  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.78 
 
 
828 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379419  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4098  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.8 
 
 
828 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227431  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03607  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38 
 
 
886 aa  512  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0056  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.7 
 
 
878 aa  500  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.753755 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0194  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  35.31 
 
 
799 aa  490  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0345  glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.78 
 
 
863 aa  486  1e-136  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.327765  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0310  glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.78 
 
 
863 aa  484  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0861  glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.96 
 
 
838 aa  483  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0145  glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.98 
 
 
930 aa  428  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0134  glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.33 
 
 
930 aa  426  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0908404  normal  0.57314 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0165  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.11 
 
 
944 aa  396  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.388092  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1991  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  30.58 
 
 
881 aa  280  7e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0003746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3097  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.01 
 
 
887 aa  249  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2571  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  31.72 
 
 
866 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2476  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  31.93 
 
 
869 aa  227  6e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.930155  normal  0.326716 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2667  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  31.54 
 
 
866 aa  224  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1289  glycerol-3-phosphate acyltransferase  31 
 
 
867 aa  217  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153054  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00206  acyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11030)  28.86 
 
 
806 aa  169  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0934118  normal  0.404402 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4652  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.18 
 
 
750 aa  160  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3623  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.26 
 
 
790 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.910554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3618  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.26 
 
 
790 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3691  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.26 
 
 
790 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103216  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2565  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.64 
 
 
783 aa  134  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.302237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12503  glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.45 
 
 
789 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4074  glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.67 
 
 
783 aa  127  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204075  normal  0.946576 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0795  glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.87 
 
 
495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11583  glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.32 
 
 
621 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.665095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5001  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.03 
 
 
623 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59314  predicted protein  23.22 
 
 
811 aa  110  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0194  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.66 
 
 
783 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3105  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.65 
 
 
476 aa  94.4  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.36 
 
 
480 aa  85.5  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0283  hypothetical protein  28.99 
 
 
551 aa  62.8  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3150  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.26 
 
 
548 aa  61.2  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142438  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44189  predicted protein  28.81 
 
 
1560 aa  58.9  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1140  hypothetical protein  24.78 
 
 
387 aa  44.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>