92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0201 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00269  glycerol-3-phosphate acyltransferase  50.63 
 
 		 790 aa  802    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3987  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.4 
 
 		 807 aa  783    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.487396 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3862  glycerol-3-phosphate acyltransferase  51.06 
 
 		 828 aa  772    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4308  glycerol-3-phosphate acyltransferase  79.63 
 
 		 807 aa  1326    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3996  glycerol-3-phosphate acyltransferase  81.99 
 
 		 807 aa  1374    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4462  glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.81 
 
 		 821 aa  767    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0201  glycerol-3-phosphate acyltransferase  100 
 
 		 807 aa  1667    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4594  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.4 
 
 		 807 aa  783    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4281  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.4 
 
 		 807 aa  783    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4503  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.4 
 
 		 827 aa  782    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3772  glycerol-3-phosphate acyltransferase  51.06 
 
 		 825 aa  772    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4177  glycerol-3-phosphate acyltransferase  79.63 
 
 		 807 aa  1326    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2422  glycerol-3-phosphate acyltransferase  50.76 
 
 		 811 aa  799    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3779  glycerol-3-phosphate acyltransferase  79.13 
 
 		 807 aa  1328    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0245  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.04 
 
 		 806 aa  773    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.659891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3530  glycerol-3-phosphate acyltransferase  83 
 
 		 807 aa  1402    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0157  glycerol-3-phosphate acyltransferase  79.5 
 
 		 807 aa  1324    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4629  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.53 
 
 		 806 aa  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.201291 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002147  glycerol-3-phosphate acyltransferase  51.06 
 
 		 758 aa  776    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0731  glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.55 
 
 		 822 aa  766    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.358742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0512  glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.42 
 
 		 822 aa  765    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3526  glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.45 
 
 		 825 aa  782    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3400  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.53 
 
 		 827 aa  776    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.841404  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4109  glycerol-3-phosphate acyltransferase  79.63 
 
 		 807 aa  1324    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5522  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.4 
 
 		 807 aa  783    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.222297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2894  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.64 
 
 		 807 aa  796    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03913  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.4 
 
 		 807 aa  783    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.818357  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4492  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.53 
 
 		 806 aa  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.32327  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04015  glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.12 
 
 		 818 aa  721    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4427  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.41 
 
 		 806 aa  783    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000489511 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4577  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.53 
 
 		 806 aa  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4578  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.53 
 
 		 806 aa  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153091  normal  0.0823596 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4556  glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.4 
 
 		 807 aa  783    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0181  glycerol-3-phosphate acyltransferase  90.05 
 
 		 807 aa  1461    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3514  glycerol-3-phosphate acyltransferase  75.28 
 
 		 807 aa  1273    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4248  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  48.1 
 
 		 811 aa  767    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0385  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.32 
 
 		 811 aa  725    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3788  glycerol-3-phosphate acyltransferase  79.75 
 
 		 807 aa  1339    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3861  glycerol-3-phosphate acyltransferase  79.88 
 
 		 807 aa  1339    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.761394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0261  glycerol-3-phosphate acyltransferase  75.78 
 
 		 807 aa  1249    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3988  glycerol-3-phosphate acyltransferase  79.63 
 
 		 807 aa  1336    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.740194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3480  glycerol-3-phosphate acyltransferase  75.22 
 
 		 807 aa  1277    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4602  glycerol-3-phosphate acyltransferase  79.63 
 
 		 809 aa  1328    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0133  glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.72 
 
 		 811 aa  695    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3952  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  48.4 
 
 		 807 aa  783    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3091  glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.1 
 
 		 827 aa  587  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0020  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.42 
 
 		 821 aa  587  1e-166  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1466  glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.71 
 
 		 834 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.077287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16860  glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.71 
 
 		 834 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00942746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4203  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.15 
 
 		 828 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.328155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1084  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.29 
 
 		 834 aa  580  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1126  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.03 
 
 		 828 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.34599  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1520  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.15 
 
 		 828 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379419  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1328  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.46 
 
 		 833 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0851055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1520  glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.15 
 
 		 833 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563875  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4098  glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.46 
 
 		 828 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2228  glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.35 
 
 		 823 aa  561  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03607  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.59 
 
 		 886 aa  532  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0194  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  38.15 
 
 		 799 aa  498  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0861  glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.71 
 
 		 838 aa  497  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0056  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.82 
 
 		 878 aa  496  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753755 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0345  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.09 
 
 		 863 aa  488  1e-136  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.327765  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0310  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.22 
 
 		 863 aa  489  1e-136  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0134  glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.83 
 
 		 930 aa  419  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0908404  normal  0.57314 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0145  glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.01 
 
 		 930 aa  422  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0165  glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.56 
 
 		 944 aa  381  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.388092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1991  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  30.11 
 
 		 881 aa  293  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0003746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3097  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.96 
 
 		 887 aa  290  5.0000000000000004e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2571  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  31.42 
 
 		 866 aa  244  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2667  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  31.24 
 
 		 866 aa  239  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2476  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  29.47 
 
 		 869 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.930155  normal  0.326716 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1289  glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.93 
 
 		 867 aa  231  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153054  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00206  acyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11030)  26.97 
 
 		 806 aa  163  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0934118  normal  0.404402 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4652  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.29 
 
 		 750 aa  159  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3691  glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.34 
 
 		 790 aa  138  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3618  glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.34 
 
 		 790 aa  138  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140415  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3623  glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.34 
 
 		 790 aa  138  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.910554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2565  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.25 
 
 		 783 aa  135  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.302237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12503  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.68 
 
 		 789 aa  134  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4074  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.9 
 
 		 783 aa  126  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204075  normal  0.946576 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11583  glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.17 
 
 		 621 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.665095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0795  glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.19 
 
 		 495 aa  118  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5001  glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.58 
 
 		 623 aa  114  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0194  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.93 
 
 		 783 aa  105  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59314  predicted protein  31.64 
 
 		 811 aa  102  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3105  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.47 
 
 		 476 aa  100  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.07 
 
 		 480 aa  95.5  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44189  predicted protein  27.85 
 
 		 1560 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3150  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.01 
 
 		 548 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142438  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0283  hypothetical protein  27.91 
 
 		 551 aa  50.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0980  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.24 
 
 		 388 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1140  hypothetical protein  25.96 
 
 		 387 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>