46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1140 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0756  phospholipid/glycerol acyltransferase  81.15 
 
 		 423 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4433  phospholipid/glycerol acyltransferase  80.63 
 
 		 389 aa  650    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1140  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  798    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0980  phospholipid/glycerol acyltransferase  94.32 
 
 		 388 aa  762    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4719  phospholipid/glycerol acyltransferase  84.75 
 
 		 388 aa  692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.301329  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0797  phospholipid/glycerol acyltransferase  80.89 
 
 		 388 aa  649    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0783  phospholipid/glycerol acyltransferase  81.15 
 
 		 388 aa  653    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41290  acyltransferase  75.97 
 
 		 388 aa  605  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5284  hypothetical protein  74.87 
 
 		 386 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61360  hypothetical protein  74.87 
 
 		 386 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.528494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3672  phospholipid/glycerol acyltransferase  74.42 
 
 		 387 aa  584  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0318  hypothetical protein  51.34 
 
 		 372 aa  350  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0302237  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2170  phospholipid/glycerol acyltransferase  50.26 
 
 		 392 aa  345  7e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2382  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  44.68 
 
 		 387 aa  345  8.999999999999999e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679133 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001345  hypothetical protein  47.86 
 
 		 369 aa  334  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05234  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  46.26 
 
 		 368 aa  329  5.0000000000000004e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0611  hypothetical protein  43.88 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.26573  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3186  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.21 
 
 		 371 aa  319  6e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187487  normal  0.0571033 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4244  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.6 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0569611  hitchhiker  0.00000000098519 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.93 
 
 		 401 aa  312  6.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3117  hypothetical protein  40.26 
 
 		 375 aa  278  8e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0728  hypothetical protein  37.12 
 
 		 388 aa  227  3e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1279  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.31 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412644  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0264  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.08 
 
 		 377 aa  199  5e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.173389  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3995  hypothetical protein  33.64 
 
 		 378 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04015  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.29 
 
 		 818 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4248  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  25.77 
 
 		 811 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3514  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25 
 
 		 807 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4462  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.78 
 
 		 821 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5522  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.66 
 
 		 807 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.222297  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3952  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  24.66 
 
 		 807 aa  43.9  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03913  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.66 
 
 		 807 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.818357  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4556  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.66 
 
 		 807 aa  43.9  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4503  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.66 
 
 		 827 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3987  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.66 
 
 		 807 aa  43.9  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.487396 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4594  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.66 
 
 		 807 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4281  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.66 
 
 		 807 aa  43.9  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0245  glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.91 
 
 		 806 aa  43.5  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.659891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4578  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.2 
 
 		 806 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153091  normal  0.0823596 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4577  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.2 
 
 		 806 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4427  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.2 
 
 		 806 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000489511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4492  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.2 
 
 		 806 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.32327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4629  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.2 
 
 		 806 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.201291 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2894  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.8 
 
 		 807 aa  43.1  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3400  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.56 
 
 		 827 aa  43.1  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.841404  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0194  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  25.11 
 
 		 799 aa  43.1  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>