25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0611 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0611  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  755    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.26573  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001345  hypothetical protein  62.36 
 
 
369 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05234  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  61.98 
 
 
368 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0318  hypothetical protein  60.99 
 
 
372 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0302237  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3186  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.48 
 
 
371 aa  364  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187487  normal  0.0571033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41290  acyltransferase  46.54 
 
 
388 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4433  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.21 
 
 
389 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61360  hypothetical protein  45.48 
 
 
386 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.528494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0797  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.21 
 
 
388 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5284  hypothetical protein  44.68 
 
 
386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0756  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.95 
 
 
423 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0783  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.95 
 
 
388 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3672  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.15 
 
 
387 aa  332  8e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4719  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.62 
 
 
388 aa  325  7e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.301329  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4244  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.15 
 
 
368 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0569611  hitchhiker  0.00000000098519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1140  hypothetical protein  43.88 
 
 
387 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423166  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.82 
 
 
401 aa  317  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653304  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0980  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.82 
 
 
388 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101796  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2170  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.59 
 
 
392 aa  314  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2382  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  47.34 
 
 
387 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679133 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3117  hypothetical protein  41.02 
 
 
375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1279  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.65 
 
 
378 aa  226  7e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412644  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0264  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.94 
 
 
377 aa  211  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.173389  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0728  hypothetical protein  34.46 
 
 
388 aa  193  3e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3995  hypothetical protein  32.57 
 
 
378 aa  168  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>