28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0756 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0756  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 		 423 aa  877    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1140  hypothetical protein  81.15 
 
 		 387 aa  652    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0980  phospholipid/glycerol acyltransferase  82.51 
 
 		 388 aa  666    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4719  phospholipid/glycerol acyltransferase  85.31 
 
 		 388 aa  697    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.301329  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4433  phospholipid/glycerol acyltransferase  94.6 
 
 		 389 aa  769    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0797  phospholipid/glycerol acyltransferase  97.94 
 
 		 388 aa  791    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0783  phospholipid/glycerol acyltransferase  99.48 
 
 		 388 aa  801    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41290  acyltransferase  77.58 
 
 		 388 aa  619  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61360  hypothetical protein  75.65 
 
 		 386 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.528494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5284  hypothetical protein  75.65 
 
 		 386 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3672  phospholipid/glycerol acyltransferase  75.72 
 
 		 387 aa  593  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2382  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  46.28 
 
 		 387 aa  348  8e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679133 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0318  hypothetical protein  48.93 
 
 		 372 aa  339  5e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0302237  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2170  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.89 
 
 		 392 aa  338  9e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001345  hypothetical protein  46.52 
 
 		 369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0611  hypothetical protein  44.95 
 
 		 367 aa  336  5.999999999999999e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.26573  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05234  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  46.26 
 
 		 368 aa  332  6e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.25 
 
 		 401 aa  332  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.653304  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4244  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.53 
 
 		 368 aa  330  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0569611  hitchhiker  0.00000000098519 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3186  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.86 
 
 		 371 aa  310  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187487  normal  0.0571033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3117  hypothetical protein  39.47 
 
 		 375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0728  hypothetical protein  38.75 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1279  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.58 
 
 		 378 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412644  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0264  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.91 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.173389  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3995  hypothetical protein  33.09 
 
 		 378 aa  163  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04015  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.77 
 
 		 818 aa  46.6  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4248  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  24.39 
 
 		 811 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0385  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.42 
 
 		 811 aa  43.1  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>