More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_A17 on replicon NC_008496
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008496  LEUM_A17  transposase  100 
 
 
220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A28  transposase  100 
 
 
220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A33  transposase  97.07 
 
 
280 aa  413  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00683665  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1009  transposase  98.96 
 
 
267 aa  395  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00631408  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1494  transposase  40.23 
 
 
247 aa  138  7e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.750811  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A02  hypothetical protein  39.43 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.918098  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0992  transposase  57.94 
 
 
185 aa  106  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0645  IS30 family transposase  34.38 
 
 
300 aa  92.4  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.358598  normal  0.401127 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0599  IS30 family transposase  35.29 
 
 
292 aa  89.4  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  35.79 
 
 
286 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  35.79 
 
 
286 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  35.79 
 
 
286 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  35.79 
 
 
286 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  35.79 
 
 
286 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0631  integrase catalytic subunit  34.92 
 
 
272 aa  87  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.417542  normal  0.185769 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1068  integrase catalytic subunit  34.9 
 
 
301 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1614  integrase catalytic subunit  34.9 
 
 
301 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341708  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2863  integrase catalytic subunit  34.9 
 
 
301 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147732  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2371  integrase catalytic subunit  34.9 
 
 
301 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0574  integrase catalytic subunit  34.9 
 
 
301 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344122  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3688  integrase catalytic subunit  34.9 
 
 
301 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0620  integrase catalytic subunit  34.9 
 
 
301 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4620  integrase catalytic subunit  34.9 
 
 
301 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3700  integrase catalytic subunit  34.9 
 
 
301 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.484261  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4642  integrase catalytic subunit  34.9 
 
 
301 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5497  integrase catalytic subunit  34.9 
 
 
301 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295724  normal  0.115233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4633  integrase catalytic subunit  34.9 
 
 
301 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2243  integrase catalytic subunit  34.9 
 
 
301 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0365379  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0017  IS30 family transposase  35.26 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.701349  hitchhiker  0.00772607 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1687  IS30 family transposase  35.26 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0638598  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1230  integrase catalytic subunit  34.57 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.460444 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1165  integrase catalytic subunit  34.57 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  35.11 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1495  integrase catalytic subunit  34.57 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.988108  normal  0.543791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  34.92 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  35.16 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0652  integrase catalytic subunit  32.83 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00967506  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  32.83 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1980  integrase catalytic subunit  32.83 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.340546  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1991  integrase catalytic subunit  32.83 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  32.83 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  34.39 
 
 
279 aa  82  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1028  integrase catalytic subunit  32.31 
 
 
284 aa  81.6  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0775486 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1120  integrase catalytic subunit  32.31 
 
 
284 aa  81.6  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1315  integrase catalytic subunit  32.31 
 
 
284 aa  81.6  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1356  integrase catalytic subunit  32.31 
 
 
284 aa  81.6  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278768 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1476  integrase catalytic subunit  32.31 
 
 
284 aa  81.6  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.725105  normal  0.179126 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0731  integrase catalytic subunit  32.31 
 
 
284 aa  81.6  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.100278  decreased coverage  0.000000433601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1053  integrase catalytic subunit  32.31 
 
 
284 aa  81.6  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1024  integrase catalytic subunit  32.31 
 
 
284 aa  81.6  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0659749 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2285  integrase catalytic region  29.8 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  32.83 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1946  integrase catalytic region  29.8 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2163  integrase catalytic region  29.8 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674408  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  34.16 
 
 
293 aa  78.6  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  31.15 
 
 
271 aa  78.6  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  34.16 
 
 
293 aa  78.6  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  34.16 
 
 
293 aa  78.6  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  34.65 
 
 
293 aa  78.6  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  34.65 
 
 
293 aa  78.6  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3841  integrase catalytic subunit  37.5 
 
 
277 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0738  integrase catalytic subunit  37.5 
 
 
277 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3082  integrase catalytic region  37.41 
 
 
277 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0276  integrase catalytic subunit  37.5 
 
 
277 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  33.88 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  33.51 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  31.69 
 
 
311 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0234  integrase catalytic subunit  33.82 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.100698 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  31.58 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  31.58 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  29.59 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  29.59 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  30.69 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  29.59 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  30.69 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  31.58 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  31.58 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2078  ISSd1, transposase orfB  32.24 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3958  ISSd1, transposase orfB  32.24 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4445  IS3 family transposase  34.9 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323059  hitchhiker  0.0000497697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1599  ISSd1, transposase orfB  32.24 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000676814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1713  ISSd1, transposase orfB  32.24 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4657  ISSd1, transposase orfB  32.24 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.326182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2939  ISSd1, transposase orfB  32.24 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2040  ISSd1, transposase orfB  32.24 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0263  ISSd1, transposase orfB  32.24 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0897  ISSd1, transposase orfB  32.24 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1278  ISSd1, transposase orfB  32.24 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1008  ISSd1, transposase orfB  32.24 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.660262  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2144  ISSd1, transposase orfB  32.24 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2182  ISSd1, transposase orfB  32.24 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0788896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2035  ISSd1, transposase orfB  32.24 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4975  integrase core subunit  33.15 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0242  ISSd1, transposase orfB  32.24 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.711406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1660  ISSd1, transposase orfB  32.24 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1364  ISSd1, transposase orfB  32.24 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4367  ISSd1, transposase orfB  32.24 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4403  ISSd1, transposase orfB  32.24 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0999  ISSd1, transposase orfB  32.24 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00251682  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  34.22 
 
 
277 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>