More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_15990 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_13260  DNA topoisomerase IV subunit B  71.57 
 
 		 701 aa  1008    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0630779  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0298  DNA topoisomerase plasmid partition protein B  56.84 
 
 		 758 aa  833    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15910  DNA topoisomerase IV subunit B  69.87 
 
 		 709 aa  1016    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.39843 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2055  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  71.53 
 
 		 713 aa  999    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2280  DNA gyrase subunit B domain protein  50.14 
 
 		 680 aa  644    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.557074  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08220  DNA topoisomerase IV subunit B  50 
 
 		 701 aa  660    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2134  DNA topoisomerase IV subunit B  69.14 
 
 		 702 aa  942    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1425  DNA topoisomerase IV subunit B  69.82 
 
 		 723 aa  1008    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14380  DNA topoisomerase IV subunit B  70.9 
 
 		 705 aa  995    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1922  DNA topoisomerase IV subunit B  70.23 
 
 		 708 aa  975    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.921776  normal  0.0348119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2394  DNA topoisomerase  66.71 
 
 		 690 aa  893    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367142  normal  0.572955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1611  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  65.87 
 
 		 696 aa  892    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00143665  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3307  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  66.43 
 
 		 701 aa  917    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1674  DNA gyrase subunit B  51.29 
 
 		 730 aa  674    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.759972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1534  DNA topoisomerase IV subunit B  69.66 
 
 		 693 aa  947    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.300498  normal  0.0102248 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1988  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  71.89 
 
 		 715 aa  1048    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15990  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 		 710 aa  1447    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.440467  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1763  DNA topoisomerase IV subunit B  62.8 
 
 		 709 aa  882    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1680  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  51.43 
 
 		 702 aa  679    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.313615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1619  DNA topoisomerase IV subunit B  73.53 
 
 		 702 aa  1071    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0681707  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1613  DNA topoisomerase IV subunit B  72.96 
 
 		 702 aa  1058    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000263124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7084  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  66.15 
 
 		 690 aa  872    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1427  DNA topoisomerase IV subunit B  64.08 
 
 		 703 aa  841    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2958  DNA topoisomerase IV subunit B  63.21 
 
 		 710 aa  886    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414962  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  45.66 
 
 		 628 aa  556  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0693  DNA gyrase, B subunit, C-terminal domain protein  59.43 
 
 		 792 aa  551  1e-155  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  44.75 
 
 		 636 aa  543  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  43.85 
 
 		 632 aa  542  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  45.64 
 
 		 633 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  44.54 
 
 		 636 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  42.53 
 
 		 675 aa  532  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  43.5 
 
 		 644 aa  535  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  46.69 
 
 		 651 aa  535  1e-150  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  43.16 
 
 		 649 aa  526  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  43.75 
 
 		 644 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  41.51 
 
 		 637 aa  524  1e-147  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  42.53 
 
 		 647 aa  518  1.0000000000000001e-145  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  44.46 
 
 		 649 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  43.93 
 
 		 644 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  43.44 
 
 		 714 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1432  DNA gyrase subunit B  43 
 
 		 696 aa  512  1e-144  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  43.82 
 
 		 637 aa  512  1e-144  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  41.18 
 
 		 640 aa  513  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  43.62 
 
 		 641 aa  514  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  42.57 
 
 		 635 aa  514  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  43.47 
 
 		 648 aa  513  1e-144  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  41.37 
 
 		 686 aa  514  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  44.16 
 
 		 644 aa  514  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  44.21 
 
 		 644 aa  510  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  44.51 
 
 		 650 aa  510  1e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  43.04 
 
 		 645 aa  511  1e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  42.73 
 
 		 651 aa  510  1e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  42.2 
 
 		 633 aa  511  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0041  DNA gyrase, B subunit  43.99 
 
 		 691 aa  511  1e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  42.86 
 
 		 648 aa  511  1e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  41.81 
 
 		 633 aa  510  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  46.13 
 
 		 637 aa  511  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  43.04 
 
 		 652 aa  511  1e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  40.46 
 
 		 650 aa  509  1e-143  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  42.49 
 
 		 642 aa  510  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  41.87 
 
 		 650 aa  511  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  44.94 
 
 		 650 aa  509  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  43.31 
 
 		 627 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  43.48 
 
 		 635 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  43.78 
 
 		 654 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  42.59 
 
 		 634 aa  508  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  41.82 
 
 		 637 aa  505  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  42.09 
 
 		 634 aa  503  1e-141  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  43.13 
 
 		 636 aa  503  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  43.02 
 
 		 656 aa  505  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0009  DNA gyrase, B subunit  42.74 
 
 		 688 aa  504  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  44.38 
 
 		 640 aa  502  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00050  DNA gyrase subunit B  43.89 
 
 		 720 aa  504  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1634  DNA gyrase, B subunit  40.05 
 
 		 708 aa  504  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00000582851  hitchhiker  0.000898108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0006  DNA gyrase subunit B  44.81 
 
 		 647 aa  502  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.195447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  44.44 
 
 		 640 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  41.38 
 
 		 675 aa  501  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  43.8 
 
 		 643 aa  501  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  43.38 
 
 		 661 aa  501  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0335  DNA gyrase, B subunit  43.53 
 
 		 645 aa  501  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  41.1 
 
 		 675 aa  500  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0006  DNA gyrase B subunit  41.52 
 
 		 656 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0007  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  43.6 
 
 		 647 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  42.51 
 
 		 643 aa  496  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2927  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  42.86 
 
 		 643 aa  497  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.192259 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  44.14 
 
 		 649 aa  499  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  42.8 
 
 		 640 aa  496  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  41.72 
 
 		 633 aa  496  1e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0005  DNA gyrase, B subunit  44.29 
 
 		 655 aa  496  1e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.452102  hitchhiker  2.3265900000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  43.9 
 
 		 672 aa  498  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  43.14 
 
 		 643 aa  496  1e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  46.5 
 
 		 636 aa  495  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  43.04 
 
 		 643 aa  495  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0006  DNA gyrase, B subunit  43.48 
 
 		 681 aa  498  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  41.11 
 
 		 658 aa  495  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  43 
 
 		 640 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  44.14 
 
 		 661 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  42.53 
 
 		 641 aa  493  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  39.74 
 
 		 647 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  41.83 
 
 		 650 aa  493  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>