More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1534 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7084  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  66.18 
 
 		 690 aa  866    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15910  DNA topoisomerase IV subunit B  69.87 
 
 		 709 aa  995    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.39843 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08220  DNA topoisomerase IV subunit B  51.88 
 
 		 701 aa  665    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1922  DNA topoisomerase IV subunit B  70.13 
 
 		 708 aa  949    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.921776  normal  0.0348119 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2134  DNA topoisomerase IV subunit B  66.28 
 
 		 702 aa  917    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1613  DNA topoisomerase IV subunit B  70.61 
 
 		 702 aa  998    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000263124 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1988  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  72.25 
 
 		 715 aa  1023    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13260  DNA topoisomerase IV subunit B  69.38 
 
 		 701 aa  937    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0630779  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1680  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  51.45 
 
 		 702 aa  672    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.313615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3307  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  65.66 
 
 		 701 aa  905    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1763  DNA topoisomerase IV subunit B  65.01 
 
 		 709 aa  909    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15990  DNA topoisomerase IV subunit B  69.66 
 
 		 710 aa  971    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.440467  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1611  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  64.37 
 
 		 696 aa  870    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00143665  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14380  DNA topoisomerase IV subunit B  67.23 
 
 		 705 aa  939    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219093  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0298  DNA topoisomerase plasmid partition protein B  53.96 
 
 		 758 aa  784    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2280  DNA gyrase subunit B domain protein  51.61 
 
 		 680 aa  643    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.557074  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2394  DNA topoisomerase  67.2 
 
 		 690 aa  877    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367142  normal  0.572955 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1425  DNA topoisomerase IV subunit B  68.22 
 
 		 723 aa  966    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2055  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  69.76 
 
 		 713 aa  946    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1619  DNA topoisomerase IV subunit B  69.47 
 
 		 702 aa  986    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0681707  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1427  DNA topoisomerase IV subunit B  65.37 
 
 		 703 aa  845    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1534  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 		 693 aa  1401    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.300498  normal  0.0102248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2958  DNA topoisomerase IV subunit B  65.99 
 
 		 710 aa  922    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414962  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1674  DNA gyrase subunit B  51.59 
 
 		 730 aa  670    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.759972 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  43.27 
 
 		 675 aa  545  1e-154  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  46.73 
 
 		 628 aa  546  1e-154  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  45.9 
 
 		 636 aa  543  1e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  45.82 
 
 		 636 aa  545  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  45.47 
 
 		 633 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  44.73 
 
 		 632 aa  537  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0693  DNA gyrase, B subunit, C-terminal domain protein  57.33 
 
 		 792 aa  533  1e-150  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  44.59 
 
 		 635 aa  535  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  42.84 
 
 		 642 aa  523  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  43.72 
 
 		 641 aa  523  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  44.04 
 
 		 649 aa  525  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  42.28 
 
 		 637 aa  524  1e-147  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  43.38 
 
 		 650 aa  521  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  42.92 
 
 		 640 aa  519  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  44.85 
 
 		 651 aa  519  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  44.84 
 
 		 633 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  41.55 
 
 		 650 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  44.38 
 
 		 644 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  41.16 
 
 		 633 aa  515  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  46.29 
 
 		 637 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  44.31 
 
 		 645 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  44.79 
 
 		 638 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  43.45 
 
 		 686 aa  514  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  44.3 
 
 		 661 aa  512  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  44.28 
 
 		 650 aa  515  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  46.57 
 
 		 636 aa  512  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  42.1 
 
 		 637 aa  513  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1432  DNA gyrase subunit B  44.13 
 
 		 696 aa  515  1e-144  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  43.37 
 
 		 637 aa  514  1e-144  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  42.96 
 
 		 642 aa  511  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  43.43 
 
 		 656 aa  511  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  43.57 
 
 		 648 aa  511  1e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  41.37 
 
 		 634 aa  506  9.999999999999999e-143  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  41.87 
 
 		 665 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  42.63 
 
 		 636 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  43.45 
 
 		 634 aa  506  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  42.79 
 
 		 643 aa  505  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  43.26 
 
 		 644 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  42.05 
 
 		 644 aa  508  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  43.54 
 
 		 627 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  43.07 
 
 		 647 aa  507  9.999999999999999e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0005  DNA gyrase, B subunit  44.04 
 
 		 647 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  42.5 
 
 		 651 aa  503  1e-141  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0041  DNA gyrase, B subunit  44.14 
 
 		 691 aa  503  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  44.18 
 
 		 643 aa  504  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  43.95 
 
 		 635 aa  504  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  42.86 
 
 		 644 aa  502  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  43.27 
 
 		 644 aa  505  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  44.46 
 
 		 640 aa  502  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  43 
 
 		 641 aa  505  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1634  DNA gyrase, B subunit  39.57 
 
 		 708 aa  502  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00000582851  hitchhiker  0.000898108 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  42.03 
 
 		 642 aa  505  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  44.05 
 
 		 650 aa  503  1e-141  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  43.28 
 
 		 648 aa  504  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  42.54 
 
 		 714 aa  502  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  42.55 
 
 		 654 aa  501  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  43.97 
 
 		 644 aa  499  1e-140  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0009  DNA gyrase, B subunit  43.88 
 
 		 688 aa  499  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  41.83 
 
 		 633 aa  500  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0007  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  43.92 
 
 		 647 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  43.68 
 
 		 640 aa  500  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  43.33 
 
 		 643 aa  500  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  43.68 
 
 		 640 aa  500  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  45.15 
 
 		 640 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0006  DNA gyrase B subunit  43.11 
 
 		 656 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  43.26 
 
 		 640 aa  499  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  42.65 
 
 		 649 aa  496  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  41.44 
 
 		 655 aa  496  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  42.16 
 
 		 655 aa  496  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  42.61 
 
 		 643 aa  497  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  43.42 
 
 		 654 aa  497  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  43.49 
 
 		 650 aa  494  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  43.82 
 
 		 649 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0006  DNA gyrase subunit B  44.2 
 
 		 647 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.195447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  41.75 
 
 		 658 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  40.61 
 
 		 655 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>