290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2406 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2406  mannitol dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 482 aa  960    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0249546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0503  mannitol dehydrogenase  50 
 
 		 482 aa  427  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0788  Mannitol dehydrogenase domain protein  52.12 
 
 		 486 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4796  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.12 
 
 		 462 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3198  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.49 
 
 		 488 aa  348  9e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3317  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.35 
 
 		 431 aa  320  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  36.5 
 
 		 492 aa  289  7e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31040  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  38.37 
 
 		 423 aa  266  5e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  34.54 
 
 		 490 aa  249  7e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  35.7 
 
 		 491 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  38.95 
 
 		 493 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  39.19 
 
 		 510 aa  248  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0601  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.81 
 
 		 452 aa  247  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  36.26 
 
 		 451 aa  246  6e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  38.01 
 
 		 496 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  35.27 
 
 		 490 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  36 
 
 		 493 aa  240  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  35.28 
 
 		 491 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  35.05 
 
 		 490 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  35.05 
 
 		 490 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  37.07 
 
 		 492 aa  240  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  35.05 
 
 		 490 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.72 
 
 		 486 aa  236  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  36.13 
 
 		 491 aa  236  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  35.74 
 
 		 485 aa  233  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5060  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.04 
 
 		 483 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  33.33 
 
 		 495 aa  232  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.76 
 
 		 491 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  35.73 
 
 		 484 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.74 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.74 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  33.11 
 
 		 498 aa  231  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  33.78 
 
 		 494 aa  230  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  32.88 
 
 		 500 aa  229  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  36.34 
 
 		 470 aa  229  7e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  33.12 
 
 		 495 aa  229  9e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  35.34 
 
 		 486 aa  229  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.34 
 
 		 486 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  35.34 
 
 		 486 aa  228  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  32.84 
 
 		 528 aa  227  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  34.11 
 
 		 488 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.96 
 
 		 505 aa  227  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  31.42 
 
 		 520 aa  227  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.166758 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  34.18 
 
 		 488 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.18 
 
 		 488 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.18 
 
 		 488 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  34.18 
 
 		 488 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  34.18 
 
 		 488 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  34.18 
 
 		 488 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.48 
 
 		 486 aa  226  7e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  35.07 
 
 		 499 aa  226  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  34.18 
 
 		 488 aa  226  7e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  35.13 
 
 		 486 aa  226  9e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  35.13 
 
 		 486 aa  226  9e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.52 
 
 		 493 aa  225  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  35.34 
 
 		 486 aa  225  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  34.65 
 
 		 497 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2666  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.09 
 
 		 499 aa  224  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  35.5 
 
 		 498 aa  223  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.36 
 
 		 497 aa  223  8e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.7 
 
 		 485 aa  222  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  35.5 
 
 		 489 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  35.5 
 
 		 489 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  34.91 
 
 		 486 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  35.5 
 
 		 489 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  33.4 
 
 		 505 aa  222  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  34.91 
 
 		 486 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  35.5 
 
 		 489 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  35.5 
 
 		 489 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  35.5 
 
 		 489 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.45 
 
 		 493 aa  221  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.51 
 
 		 506 aa  221  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  33.33 
 
 		 490 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  32.63 
 
 		 486 aa  220  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  35.51 
 
 		 497 aa  220  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  32.63 
 
 		 486 aa  219  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.49 
 
 		 487 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  32.63 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  32.63 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  36.48 
 
 		 471 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  32.63 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  37.38 
 
 		 430 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  37.6 
 
 		 491 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  33.12 
 
 		 488 aa  217  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  34.35 
 
 		 493 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3280  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.28 
 
 		 484 aa  216  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.52 
 
 		 490 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  32.52 
 
 		 490 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1859  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.1 
 
 		 470 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  32.42 
 
 		 486 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  32.42 
 
 		 486 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  32.77 
 
 		 503 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  34.04 
 
 		 464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  33.48 
 
 		 459 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.84 
 
 		 493 aa  215  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  32.42 
 
 		 486 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  34.04 
 
 		 455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.15 
 
 		 509 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  36.36 
 
 		 488 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  34.28 
 
 		 478 aa  213  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>