More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2001 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2001  beta-lactamase  100 
 
 		 274 aa  570  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1900  beta-lactamase  57.2 
 
 		 297 aa  311  5.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4495  Beta-lactamase  41.67 
 
 		 301 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2834  beta-lactamase  39.92 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.764652  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1378  beta-lactamase  36.76 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.389159  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3061  beta-lactamase  32.09 
 
 		 351 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.502148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  31.64 
 
 		 429 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.84 
 
 		 416 aa  91.3  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.23 
 
 		 390 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  29.48 
 
 		 428 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.01 
 
 		 378 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  29.17 
 
 		 420 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  28.78 
 
 		 380 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  31.01 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  31.2 
 
 		 349 aa  82  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.57 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  31.53 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  30.88 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  31.22 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  30.88 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  30.88 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.24 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  30.88 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.38 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  31.22 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0275  beta-lactamase  29.13 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.35061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  31.22 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  27.38 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  27.38 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  30.21 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  30.39 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  27 
 
 		 388 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  30.39 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  25.85 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  25.08 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.77 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  26.77 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  26.77 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  25.85 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  26.77 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.77 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0398  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.44 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  27.1 
 
 		 389 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  29.02 
 
 		 370 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  26.05 
 
 		 375 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.15 
 
 		 383 aa  75.5  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.27 
 
 		 407 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.44 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  26.44 
 
 		 848 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  25.33 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  26.64 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.88 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  26.44 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.16 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.05 
 
 		 385 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  25.86 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.44 
 
 		 385 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.48 
 
 		 388 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.05 
 
 		 385 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  27.56 
 
 		 406 aa  72  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  26.24 
 
 		 388 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5306  beta-lactamase  26.06 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3510  beta-lactamase  28.87 
 
 		 409 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  25.86 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.09 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4687  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.85 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  26.23 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  30.5 
 
 		 578 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  27.49 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.37 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2105  beta-lactamase  27.41 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  23.47 
 
 		 720 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  24.77 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  23.26 
 
 		 381 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0504  beta-lactamase  26.46 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.35102  hitchhiker  0.00000257291 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  24.9 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.12 
 
 		 514 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  24.83 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  25.98 
 
 		 366 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  31.06 
 
 		 480 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.64 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  25.29 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  25.29 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  34.15 
 
 		 375 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0278  beta-lactamase  27.24 
 
 		 406 aa  66.2  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4690  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.59 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00394326  normal  0.37742 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  31.75 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1771  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.1791 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1072  Beta-lactamase  24.49 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  31.11 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3689  beta-lactamase  25.53 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  25.52 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3243  beta-lactamase  28.04 
 
 		 387 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  25.82 
 
 		 383 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  26.29 
 
 		 378 aa  62.4  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3305  beta-lactamase  28.04 
 
 		 403 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0079678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3254  beta-lactamase  28.04 
 
 		 403 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  29.51 
 
 		 566 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  27.13 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  26.09 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>