More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1066 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1066  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  487  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2154  hypothetical protein  73.73 
 
 
241 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36352  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0810  hypothetical protein  71.19 
 
 
240 aa  356  9.999999999999999e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1551  hypothetical protein  68.91 
 
 
238 aa  351  5.9999999999999994e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00373978  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1104  hypothetical protein  69.49 
 
 
239 aa  344  8e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2868  hypothetical protein  71.43 
 
 
238 aa  342  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.666015  hitchhiker  0.000154925 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0550  hypothetical protein  66.24 
 
 
243 aa  329  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.105783  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0124  hypothetical protein  64.41 
 
 
239 aa  318  3.9999999999999996e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2410  hypothetical protein  63.14 
 
 
240 aa  317  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3401  hypothetical protein  63.98 
 
 
240 aa  316  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03175  hypothetical protein  62.45 
 
 
240 aa  315  3e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2724  hypothetical protein  63.14 
 
 
240 aa  315  5e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1225  hypothetical protein  63.14 
 
 
240 aa  314  9e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1086  hypothetical protein  63.14 
 
 
241 aa  314  9e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1227  hypothetical protein  62.71 
 
 
240 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1155  hypothetical protein  63.14 
 
 
240 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706452  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1154  hypothetical protein  62.71 
 
 
240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1245  hypothetical protein  62.71 
 
 
240 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1323  hypothetical protein  62.71 
 
 
240 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1289  hypothetical protein  62.71 
 
 
240 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3408  hypothetical protein  63.71 
 
 
241 aa  309  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3065  hypothetical protein  62.29 
 
 
240 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574128  hitchhiker  0.0000000411233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2063  hypothetical protein  62.87 
 
 
241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0450  hypothetical protein  61.92 
 
 
242 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.777332  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4519  hypothetical protein  62.45 
 
 
242 aa  298  5e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.13557 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0447  hypothetical protein  60.08 
 
 
242 aa  293  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07036  hypothetical protein  61.44 
 
 
238 aa  293  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4169  hypothetical protein  56.96 
 
 
241 aa  290  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652416  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0141  hypothetical protein  61.02 
 
 
240 aa  286  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000982  hypothetical protein  61.78 
 
 
227 aa  280  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0242  hypothetical protein  45.53 
 
 
238 aa  207  9e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000674117  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0411  hypothetical protein  46.19 
 
 
238 aa  199  3e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0757755  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1645  hypothetical protein  44.26 
 
 
238 aa  198  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0393041  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0615  hypothetical protein  43.4 
 
 
239 aa  191  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000476022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0510  hypothetical protein  42.98 
 
 
239 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.887528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0453  hypothetical protein  42.98 
 
 
239 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190075  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0449  hypothetical protein  42.98 
 
 
239 aa  190  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0541  hypothetical protein  42.98 
 
 
239 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5905599999999994e-39 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0541  hypothetical protein  42.98 
 
 
239 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000461831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0577  hypothetical protein  42.98 
 
 
239 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0465  hypothetical protein  42.13 
 
 
239 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000140686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0456  hypothetical protein  42.98 
 
 
242 aa  189  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0595  hypothetical protein  42.98 
 
 
239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0672572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4761  hypothetical protein  42.55 
 
 
239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0322  hypothetical protein  43.4 
 
 
238 aa  188  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.535102  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0693  hypothetical protein  44.26 
 
 
238 aa  187  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.719863  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0708  hypothetical protein  44.26 
 
 
238 aa  187  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.934731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4750  hypothetical protein  41.28 
 
 
238 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.168616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4826  hypothetical protein  41.28 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4850  hypothetical protein  41.28 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0706778 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4901  hypothetical protein  41.28 
 
 
238 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2106  hypothetical protein  40.43 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.42847e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2265  hypothetical protein  40.43 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1660  hypothetical protein  40.43 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000398097  normal  0.0396414 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0237  hypothetical protein  41.7 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.89365  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0985  hypothetical protein  40.43 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000517844  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01895  hypothetical protein  40.43 
 
 
238 aa  182  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.332684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1670  protein of unknown function DUF28  40.43 
 
 
238 aa  182  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00376814  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01884  hypothetical protein  40.43 
 
 
238 aa  182  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.340686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1142  hypothetical protein  40.43 
 
 
238 aa  182  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394813  hitchhiker  0.000003904 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2825  hypothetical protein  40.43 
 
 
238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000953652  normal  0.63572 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0598  hypothetical protein  43.33 
 
 
237 aa  175  5e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.780908  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl546  hypothetical protein  41 
 
 
237 aa  175  6e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.04209  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4897  hypothetical protein  40 
 
 
234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374047 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  40.25 
 
 
243 aa  155  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  37.87 
 
 
239 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  40.72 
 
 
247 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  39.46 
 
 
248 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  37.02 
 
 
239 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  37.02 
 
 
239 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  38.4 
 
 
246 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  38.89 
 
 
246 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  40.72 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  40.27 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  36.91 
 
 
248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  35.47 
 
 
248 aa  145  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  36.82 
 
 
241 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1015  hypothetical protein  36.61 
 
 
242 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0984  hypothetical protein  37.05 
 
 
242 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182655  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  38.71 
 
 
248 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1953  hypothetical protein  34.03 
 
 
241 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  38.53 
 
 
243 aa  144  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1884  hypothetical protein  36.61 
 
 
242 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1385  hypothetical protein  36.61 
 
 
242 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.823747  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  35.86 
 
 
247 aa  142  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0792  hypothetical protein  36.61 
 
 
242 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166344  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1231  hypothetical protein  36.61 
 
 
242 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0358  hypothetical protein  36.61 
 
 
242 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1240  hypothetical protein  36.61 
 
 
242 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0366087  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1075  hypothetical protein  36.61 
 
 
242 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511587  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  33.62 
 
 
246 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  35.19 
 
 
246 aa  142  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  33.62 
 
 
246 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  36.13 
 
 
240 aa  142  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  33.62 
 
 
246 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  33.62 
 
 
246 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  33.62 
 
 
246 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  33.62 
 
 
246 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  36.71 
 
 
242 aa  142  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  34.32 
 
 
247 aa  142  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>