More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1670 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01895  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  481  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.332684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1670  protein of unknown function DUF28  100 
 
 		 238 aa  481  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00376814  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1142  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  481  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394813  hitchhiker  0.000003904 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2106  hypothetical protein  99.58 
 
 		 238 aa  480  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.42847e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1660  hypothetical protein  99.58 
 
 		 238 aa  480  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000398097  normal  0.0396414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01884  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  481  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.340686  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2265  hypothetical protein  99.58 
 
 		 238 aa  480  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0985  hypothetical protein  99.58 
 
 		 238 aa  480  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000517844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2825  hypothetical protein  99.16 
 
 		 238 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000953652  normal  0.63572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4826  hypothetical protein  96.22 
 
 		 238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4901  hypothetical protein  95.8 
 
 		 238 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4750  hypothetical protein  95.8 
 
 		 238 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.168616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4850  hypothetical protein  96.22 
 
 		 238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0706778 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0237  hypothetical protein  94.96 
 
 		 238 aa  465  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.89365  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4897  hypothetical protein  94.12 
 
 		 234 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374047 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0242  hypothetical protein  78.15 
 
 		 238 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000674117  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1645  hypothetical protein  76.47 
 
 		 238 aa  373  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0393041  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0411  hypothetical protein  69.49 
 
 		 238 aa  346  2e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0757755  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0465  hypothetical protein  63.4 
 
 		 239 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000140686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0456  hypothetical protein  60.17 
 
 		 242 aa  296  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4761  hypothetical protein  58.9 
 
 		 239 aa  291  8e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0615  hypothetical protein  59.32 
 
 		 239 aa  289  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000476022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0577  hypothetical protein  58.9 
 
 		 239 aa  289  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0595  hypothetical protein  58.9 
 
 		 239 aa  288  8e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0672572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0541  hypothetical protein  58.47 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5905599999999994e-39 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0510  hypothetical protein  58.47 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.887528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0453  hypothetical protein  58.47 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190075  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0449  hypothetical protein  58.47 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0541  hypothetical protein  58.47 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000461831  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0322  hypothetical protein  56.17 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.535102  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0708  hypothetical protein  55.74 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.934731  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0693  hypothetical protein  55.74 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.719863  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03175  hypothetical protein  46.81 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0550  hypothetical protein  48.1 
 
 		 243 aa  216  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.105783  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1551  hypothetical protein  45.11 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00373978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2154  hypothetical protein  44.92 
 
 		 241 aa  208  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2868  hypothetical protein  47.23 
 
 		 238 aa  207  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.666015  hitchhiker  0.000154925 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1104  hypothetical protein  45.99 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0810  hypothetical protein  43.83 
 
 		 240 aa  204  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2410  hypothetical protein  45.57 
 
 		 240 aa  201  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3401  hypothetical protein  45.11 
 
 		 240 aa  201  8e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2063  hypothetical protein  44.26 
 
 		 241 aa  201  8e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1289  hypothetical protein  45.11 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2724  hypothetical protein  44.26 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1323  hypothetical protein  45.11 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1245  hypothetical protein  45.11 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3065  hypothetical protein  45.11 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574128  hitchhiker  0.0000000411233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1225  hypothetical protein  45.11 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0447  hypothetical protein  44.3 
 
 		 242 aa  197  9e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1154  hypothetical protein  44.68 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1155  hypothetical protein  44.68 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4519  hypothetical protein  43.64 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.13557 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4169  hypothetical protein  44.49 
 
 		 241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652416  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1227  hypothetical protein  42.55 
 
 		 240 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0124  hypothetical protein  43.22 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0450  hypothetical protein  42.8 
 
 		 242 aa  192  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.777332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1086  hypothetical protein  42.98 
 
 		 241 aa  191  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3408  hypothetical protein  41.95 
 
 		 241 aa  191  9e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0141  hypothetical protein  44.49 
 
 		 240 aa  189  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07036  hypothetical protein  46.38 
 
 		 238 aa  188  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  43.72 
 
 		 246 aa  184  8e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000982  hypothetical protein  47.32 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1066  hypothetical protein  40.43 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  42.19 
 
 		 246 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  42.13 
 
 		 246 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  43.29 
 
 		 246 aa  177  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  42.44 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  42.92 
 
 		 248 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  42.92 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  42.92 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0768  hypothetical protein  40.52 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0981887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  43.16 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  41.1 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  39.92 
 
 		 243 aa  171  6.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  42.55 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  42.55 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  41.45 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1461  hypothetical protein  40.17 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  41.2 
 
 		 247 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  39.41 
 
 		 247 aa  168  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  40.34 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  40.34 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  40.34 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  40.34 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  41.88 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  40.77 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  42.92 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  42.49 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  41.63 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  42.49 
 
 		 248 aa  165  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  39.24 
 
 		 248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  41.2 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  39.24 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  39.24 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  39.91 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  39.66 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  42.31 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  41.2 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2433  hypothetical protein  41.42 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  41.1 
 
 		 246 aa  161  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>