More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1154 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1154  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1225  hypothetical protein  99.58 
 
 		 240 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1155  hypothetical protein  99.58 
 
 		 240 aa  495  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706452  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3401  hypothetical protein  97.08 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2724  hypothetical protein  93.33 
 
 		 240 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1323  hypothetical protein  87.08 
 
 		 240 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1289  hypothetical protein  87.08 
 
 		 240 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1245  hypothetical protein  87.08 
 
 		 240 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3065  hypothetical protein  86.67 
 
 		 240 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574128  hitchhiker  0.0000000411233 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2410  hypothetical protein  85.83 
 
 		 240 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1227  hypothetical protein  78.33 
 
 		 240 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1086  hypothetical protein  77.5 
 
 		 241 aa  394  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0447  hypothetical protein  77.5 
 
 		 242 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0450  hypothetical protein  78.01 
 
 		 242 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.777332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4519  hypothetical protein  78.66 
 
 		 242 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.13557 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3408  hypothetical protein  77.5 
 
 		 241 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4169  hypothetical protein  66.8 
 
 		 241 aa  347  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652416  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0550  hypothetical protein  66.53 
 
 		 243 aa  345  4e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.105783  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0124  hypothetical protein  68.62 
 
 		 239 aa  343  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03175  hypothetical protein  66.53 
 
 		 240 aa  339  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1551  hypothetical protein  66.24 
 
 		 238 aa  337  7e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00373978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0810  hypothetical protein  64.85 
 
 		 240 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2063  hypothetical protein  67.37 
 
 		 241 aa  335  2.9999999999999997e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2868  hypothetical protein  65.82 
 
 		 238 aa  327  8e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.666015  hitchhiker  0.000154925 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2154  hypothetical protein  64.17 
 
 		 241 aa  327  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36352  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07036  hypothetical protein  66.39 
 
 		 238 aa  316  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1066  hypothetical protein  62.71 
 
 		 237 aa  312  2.9999999999999996e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1104  hypothetical protein  61.09 
 
 		 239 aa  311  4.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0141  hypothetical protein  63.75 
 
 		 240 aa  311  5.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000982  hypothetical protein  66.96 
 
 		 227 aa  304  8.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0615  hypothetical protein  46.67 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000476022  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0242  hypothetical protein  48.09 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000674117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0465  hypothetical protein  46.67 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000140686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0541  hypothetical protein  46.25 
 
 		 239 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5905599999999994e-39 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0510  hypothetical protein  46.25 
 
 		 239 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.887528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0453  hypothetical protein  46.25 
 
 		 239 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190075  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0449  hypothetical protein  46.25 
 
 		 239 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0541  hypothetical protein  46.25 
 
 		 239 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000461831  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0322  hypothetical protein  48.54 
 
 		 238 aa  214  7e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.535102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0595  hypothetical protein  46.25 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0672572  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0411  hypothetical protein  46.86 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0757755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0456  hypothetical protein  45.83 
 
 		 242 aa  211  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1645  hypothetical protein  45.53 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0393041  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0577  hypothetical protein  45.42 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4761  hypothetical protein  45 
 
 		 239 aa  209  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0693  hypothetical protein  48.54 
 
 		 238 aa  205  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.719863  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0708  hypothetical protein  48.54 
 
 		 238 aa  205  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.934731  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0237  hypothetical protein  46.38 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.89365  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01895  hypothetical protein  44.68 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.332684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1670  protein of unknown function DUF28  44.68 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00376814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0985  hypothetical protein  44.68 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000517844  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2106  hypothetical protein  44.68 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.42847e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1142  hypothetical protein  44.68 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394813  hitchhiker  0.000003904 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2825  hypothetical protein  44.68 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000953652  normal  0.63572 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01884  hypothetical protein  44.68 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.340686  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2265  hypothetical protein  44.68 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1660  hypothetical protein  44.68 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000398097  normal  0.0396414 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4750  hypothetical protein  44.68 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.168616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4826  hypothetical protein  44.26 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4850  hypothetical protein  44.26 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0706778 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4901  hypothetical protein  44.26 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl546  hypothetical protein  45.64 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.04209  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4897  hypothetical protein  43.4 
 
 		 234 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374047 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0598  hypothetical protein  40.25 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.780908  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  37.34 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  36.55 
 
 		 250 aa  158  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0984  hypothetical protein  42.22 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1884  hypothetical protein  41.78 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1075  hypothetical protein  41.78 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511587  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1385  hypothetical protein  41.78 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.823747  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0792  hypothetical protein  41.78 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166344  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1015  hypothetical protein  41.33 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1240  hypothetical protein  41.78 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0366087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0358  hypothetical protein  41.78 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1231  hypothetical protein  41.78 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1301  hypothetical protein  41.52 
 
 		 242 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17975  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3259  hypothetical protein  41.52 
 
 		 242 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2629  hypothetical protein  35.95 
 
 		 251 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  37.34 
 
 		 249 aa  154  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2522  hypothetical protein  41.07 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  36.97 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  36.82 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  40 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  38.22 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  39.82 
 
 		 246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  35 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  40 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  40.44 
 
 		 246 aa  151  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2317  hypothetical protein  40.89 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.693566 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1682  hypothetical protein  40.89 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.074172  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2294  hypothetical protein  40.89 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2210  hypothetical protein  40.89 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.495132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  35.71 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  37.71 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2332  hypothetical protein  40.89 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.933086  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5621  hypothetical protein  40.44 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  35.83 
 
 		 247 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2210  hypothetical protein  36.02 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  35.68 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  36.86 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>