More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4897 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A4897  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  473  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374047 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4850  hypothetical protein  97.9 
 
 
238 aa  466  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0706778 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4901  hypothetical protein  98.32 
 
 
238 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4826  hypothetical protein  97.9 
 
 
238 aa  466  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4750  hypothetical protein  97.48 
 
 
238 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.168616 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01884  hypothetical protein  94.12 
 
 
238 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.340686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01895  hypothetical protein  94.12 
 
 
238 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.332684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1670  protein of unknown function DUF28  94.12 
 
 
238 aa  455  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00376814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2106  hypothetical protein  93.7 
 
 
238 aa  454  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.42847e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2825  hypothetical protein  94.12 
 
 
238 aa  455  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000953652  normal  0.63572 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0985  hypothetical protein  93.7 
 
 
238 aa  454  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000517844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1660  hypothetical protein  93.7 
 
 
238 aa  454  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000398097  normal  0.0396414 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1142  hypothetical protein  94.12 
 
 
238 aa  455  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394813  hitchhiker  0.000003904 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2265  hypothetical protein  93.7 
 
 
238 aa  454  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0237  hypothetical protein  94.12 
 
 
238 aa  454  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.89365  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0242  hypothetical protein  75.21 
 
 
238 aa  364  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000674117  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1645  hypothetical protein  74.37 
 
 
238 aa  358  3e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0393041  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0411  hypothetical protein  68.64 
 
 
238 aa  335  5e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0757755  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0465  hypothetical protein  60.43 
 
 
239 aa  289  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000140686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0456  hypothetical protein  58.05 
 
 
242 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4761  hypothetical protein  57.63 
 
 
239 aa  278  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0615  hypothetical protein  58.05 
 
 
239 aa  277  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000476022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0577  hypothetical protein  57.63 
 
 
239 aa  276  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0595  hypothetical protein  57.63 
 
 
239 aa  275  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0672572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0510  hypothetical protein  57.2 
 
 
239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.887528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0453  hypothetical protein  57.2 
 
 
239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190075  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0449  hypothetical protein  57.2 
 
 
239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0541  hypothetical protein  57.2 
 
 
239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000461831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0541  hypothetical protein  57.2 
 
 
239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5905599999999994e-39 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0322  hypothetical protein  53.19 
 
 
238 aa  246  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.535102  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0708  hypothetical protein  53.19 
 
 
238 aa  241  7e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.934731  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0693  hypothetical protein  53.19 
 
 
238 aa  241  7e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.719863  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03175  hypothetical protein  45.53 
 
 
240 aa  205  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1551  hypothetical protein  43.83 
 
 
238 aa  202  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00373978  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0550  hypothetical protein  45.99 
 
 
243 aa  201  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.105783  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1104  hypothetical protein  45.57 
 
 
239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2154  hypothetical protein  43.64 
 
 
241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2868  hypothetical protein  45.96 
 
 
238 aa  194  7e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.666015  hitchhiker  0.000154925 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0810  hypothetical protein  42.55 
 
 
240 aa  191  7e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2063  hypothetical protein  43.4 
 
 
241 aa  190  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3401  hypothetical protein  43.83 
 
 
240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2724  hypothetical protein  42.98 
 
 
240 aa  188  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2410  hypothetical protein  43.88 
 
 
240 aa  188  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1245  hypothetical protein  43.4 
 
 
240 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1289  hypothetical protein  43.4 
 
 
240 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1323  hypothetical protein  43.4 
 
 
240 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403322 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1225  hypothetical protein  43.83 
 
 
240 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3065  hypothetical protein  43.4 
 
 
240 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574128  hitchhiker  0.0000000411233 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4169  hypothetical protein  43.22 
 
 
241 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652416  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0447  hypothetical protein  43.7 
 
 
242 aa  186  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1227  hypothetical protein  42.13 
 
 
240 aa  186  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4519  hypothetical protein  42.8 
 
 
242 aa  186  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.13557 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1154  hypothetical protein  43.4 
 
 
240 aa  185  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1155  hypothetical protein  43.4 
 
 
240 aa  185  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706452  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1086  hypothetical protein  42.13 
 
 
241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3408  hypothetical protein  42.08 
 
 
241 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0450  hypothetical protein  41.53 
 
 
242 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.777332  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0124  hypothetical protein  42.13 
 
 
239 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  42.42 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1066  hypothetical protein  40 
 
 
237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0141  hypothetical protein  42.8 
 
 
240 aa  172  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07036  hypothetical protein  44.26 
 
 
238 aa  171  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  41.28 
 
 
246 aa  168  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000982  hypothetical protein  45.54 
 
 
227 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  40.08 
 
 
246 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  40.25 
 
 
246 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  41.13 
 
 
246 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  41.18 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  40.34 
 
 
250 aa  162  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  40.34 
 
 
250 aa  162  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  40.34 
 
 
248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  40.34 
 
 
248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  40.34 
 
 
248 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  39.66 
 
 
248 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  39.66 
 
 
248 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  39.08 
 
 
243 aa  161  8.000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  42.31 
 
 
242 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  39.66 
 
 
248 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  39.66 
 
 
248 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  38.14 
 
 
247 aa  160  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0768  hypothetical protein  39.48 
 
 
240 aa  160  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0981887  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  42.06 
 
 
243 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  40.34 
 
 
247 aa  159  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  40.77 
 
 
247 aa  158  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  39.32 
 
 
248 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  38.82 
 
 
248 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  38.66 
 
 
248 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  38.66 
 
 
248 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  42.06 
 
 
247 aa  156  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  39.24 
 
 
248 aa  156  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  37.55 
 
 
248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  39.74 
 
 
248 aa  154  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl546  hypothetical protein  41.83 
 
 
237 aa  153  2e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.04209  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  37.97 
 
 
248 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  39.06 
 
 
248 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  38.56 
 
 
248 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  41.2 
 
 
247 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  37.55 
 
 
248 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  39.48 
 
 
247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  40.77 
 
 
248 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>