More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3408 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3408  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  497  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0450  hypothetical protein  85.77 
 
 		 242 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.777332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4519  hypothetical protein  85.77 
 
 		 242 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.13557 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0447  hypothetical protein  82.08 
 
 		 242 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1086  hypothetical protein  81.67 
 
 		 241 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1227  hypothetical protein  79.92 
 
 		 240 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2724  hypothetical protein  78.75 
 
 		 240 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3401  hypothetical protein  77.92 
 
 		 240 aa  391  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2410  hypothetical protein  76.99 
 
 		 240 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1225  hypothetical protein  77.92 
 
 		 240 aa  390  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3065  hypothetical protein  76.25 
 
 		 240 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574128  hitchhiker  0.0000000411233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1289  hypothetical protein  76.67 
 
 		 240 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1323  hypothetical protein  76.67 
 
 		 240 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403322 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1154  hypothetical protein  77.5 
 
 		 240 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1245  hypothetical protein  76.67 
 
 		 240 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1155  hypothetical protein  77.08 
 
 		 240 aa  388  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2063  hypothetical protein  73.42 
 
 		 241 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0124  hypothetical protein  70.83 
 
 		 239 aa  360  8e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4169  hypothetical protein  67.08 
 
 		 241 aa  353  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652416  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0141  hypothetical protein  67.92 
 
 		 240 aa  335  3.9999999999999995e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03175  hypothetical protein  64.14 
 
 		 240 aa  331  6e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07036  hypothetical protein  67.78 
 
 		 238 aa  331  7.000000000000001e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1551  hypothetical protein  65.55 
 
 		 238 aa  328  5.0000000000000004e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00373978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2868  hypothetical protein  66.81 
 
 		 238 aa  326  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.666015  hitchhiker  0.000154925 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0810  hypothetical protein  65.42 
 
 		 240 aa  323  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0550  hypothetical protein  63.71 
 
 		 243 aa  322  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.105783  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000982  hypothetical protein  69.3 
 
 		 227 aa  321  5e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2154  hypothetical protein  64.85 
 
 		 241 aa  320  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1066  hypothetical protein  63.71 
 
 		 237 aa  309  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1104  hypothetical protein  59.83 
 
 		 239 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0465  hypothetical protein  45.61 
 
 		 239 aa  209  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000140686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0615  hypothetical protein  46.67 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000476022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0510  hypothetical protein  46.25 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.887528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0453  hypothetical protein  46.25 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190075  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0449  hypothetical protein  46.25 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0541  hypothetical protein  46.25 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5905599999999994e-39 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0456  hypothetical protein  45.61 
 
 		 242 aa  206  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0541  hypothetical protein  46.25 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000461831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0595  hypothetical protein  46.25 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0672572  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0322  hypothetical protein  46.67 
 
 		 238 aa  205  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.535102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0577  hypothetical protein  46.25 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4761  hypothetical protein  45.83 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0242  hypothetical protein  44.92 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000674117  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0693  hypothetical protein  45.42 
 
 		 238 aa  201  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.719863  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0708  hypothetical protein  45.42 
 
 		 238 aa  201  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.934731  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0411  hypothetical protein  45.42 
 
 		 238 aa  200  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0757755  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl546  hypothetical protein  47.72 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.04209  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1645  hypothetical protein  42.8 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0393041  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0237  hypothetical protein  42.8 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.89365  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4850  hypothetical protein  42.37 
 
 		 238 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0706778 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4750  hypothetical protein  42.37 
 
 		 238 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.168616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4826  hypothetical protein  42.37 
 
 		 238 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2106  hypothetical protein  41.95 
 
 		 238 aa  191  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.42847e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0985  hypothetical protein  41.95 
 
 		 238 aa  191  8e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000517844  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2265  hypothetical protein  41.95 
 
 		 238 aa  191  8e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1660  hypothetical protein  41.95 
 
 		 238 aa  191  8e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000398097  normal  0.0396414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01895  hypothetical protein  41.95 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.332684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1670  protein of unknown function DUF28  41.95 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00376814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2825  hypothetical protein  42.08 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000953652  normal  0.63572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4901  hypothetical protein  42.5 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01884  hypothetical protein  41.95 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.340686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1142  hypothetical protein  41.95 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394813  hitchhiker  0.000003904 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4897  hypothetical protein  42.08 
 
 		 234 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374047 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0598  hypothetical protein  42.32 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.780908  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  38.33 
 
 		 247 aa  158  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  38.49 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  37.92 
 
 		 247 aa  155  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  38.49 
 
 		 247 aa  155  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  40.25 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  40.25 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  40.25 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  36.82 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  36.82 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  36.82 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  36.82 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  36.82 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  36.55 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  36.82 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  37.08 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  36.4 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  37.08 
 
 		 247 aa  152  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  36.4 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  36.4 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  39.83 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  38.59 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  39.17 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  39.57 
 
 		 242 aa  151  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  35.98 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  38.75 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  39.17 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  35.98 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  35.98 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  38.08 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  35.98 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  35.98 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1301  hypothetical protein  41.26 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17975  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  38.33 
 
 		 248 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  37.5 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3259  hypothetical protein  41.52 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  36.25 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>