More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1104 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1104  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  490  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1551  hypothetical protein  72.69 
 
 		 238 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00373978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0810  hypothetical protein  72.8 
 
 		 240 aa  367  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2154  hypothetical protein  72.38 
 
 		 241 aa  363  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2868  hypothetical protein  74.37 
 
 		 238 aa  357  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.666015  hitchhiker  0.000154925 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1066  hypothetical protein  69.49 
 
 		 237 aa  344  8e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4169  hypothetical protein  61.51 
 
 		 241 aa  317  7.999999999999999e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652416  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3401  hypothetical protein  62.34 
 
 		 240 aa  317  7.999999999999999e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2724  hypothetical protein  61.51 
 
 		 240 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1225  hypothetical protein  61.51 
 
 		 240 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1289  hypothetical protein  61.09 
 
 		 240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1323  hypothetical protein  61.09 
 
 		 240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1245  hypothetical protein  61.09 
 
 		 240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1155  hypothetical protein  61.09 
 
 		 240 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1154  hypothetical protein  61.09 
 
 		 240 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3065  hypothetical protein  60.67 
 
 		 240 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574128  hitchhiker  0.0000000411233 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2410  hypothetical protein  60.25 
 
 		 240 aa  310  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03175  hypothetical protein  58.47 
 
 		 240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4519  hypothetical protein  60.25 
 
 		 242 aa  305  6e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.13557 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3408  hypothetical protein  59.83 
 
 		 241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0124  hypothetical protein  60.25 
 
 		 239 aa  301  7.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1227  hypothetical protein  58.58 
 
 		 240 aa  300  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0550  hypothetical protein  59.32 
 
 		 243 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.105783  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0450  hypothetical protein  59 
 
 		 242 aa  298  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.777332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1086  hypothetical protein  59 
 
 		 241 aa  298  5e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0447  hypothetical protein  58.75 
 
 		 242 aa  298  7e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2063  hypothetical protein  59.83 
 
 		 241 aa  297  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07036  hypothetical protein  61.09 
 
 		 238 aa  286  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0141  hypothetical protein  60.25 
 
 		 240 aa  278  5e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000982  hypothetical protein  61.4 
 
 		 227 aa  274  9e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0242  hypothetical protein  48.52 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000674117  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0411  hypothetical protein  47.92 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0757755  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1645  hypothetical protein  46.84 
 
 		 238 aa  211  7.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0393041  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4750  hypothetical protein  46.84 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.168616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4850  hypothetical protein  46.84 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0706778 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4826  hypothetical protein  46.84 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0237  hypothetical protein  47.26 
 
 		 238 aa  208  5e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.89365  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4901  hypothetical protein  46.84 
 
 		 238 aa  208  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2265  hypothetical protein  45.99 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2106  hypothetical protein  45.99 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.42847e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1660  hypothetical protein  45.99 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000398097  normal  0.0396414 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0985  hypothetical protein  45.99 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000517844  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01895  hypothetical protein  45.99 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.332684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1670  protein of unknown function DUF28  45.99 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00376814  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01884  hypothetical protein  45.99 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.340686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1142  hypothetical protein  45.99 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394813  hitchhiker  0.000003904 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2825  hypothetical protein  45.99 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000953652  normal  0.63572 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0322  hypothetical protein  44.35 
 
 		 238 aa  197  9e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.535102  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4897  hypothetical protein  45.57 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374047 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0465  hypothetical protein  42.68 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000140686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0615  hypothetical protein  43.57 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000476022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0453  hypothetical protein  43.15 
 
 		 239 aa  194  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0510  hypothetical protein  43.15 
 
 		 239 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.887528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0449  hypothetical protein  43.15 
 
 		 239 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0541  hypothetical protein  43.15 
 
 		 239 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000461831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0541  hypothetical protein  43.15 
 
 		 239 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5905599999999994e-39 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0595  hypothetical protein  43.15 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0672572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0456  hypothetical protein  42.92 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0577  hypothetical protein  42.74 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0708  hypothetical protein  44.77 
 
 		 238 aa  191  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.934731  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0693  hypothetical protein  44.77 
 
 		 238 aa  191  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.719863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4761  hypothetical protein  42.74 
 
 		 239 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl546  hypothetical protein  40 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.04209  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0598  hypothetical protein  37.08 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.780908  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  36.55 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  37.24 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  38.24 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  38.24 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  37.24 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  36.93 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  37.08 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  35.98 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  36.67 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  37.39 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  36.93 
 
 		 248 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1249  hypothetical protein  36.77 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  35.56 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1249  hypothetical protein  36.32 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  35.27 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  37.67 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  35.32 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  35.27 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  34.18 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  33.05 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  34.18 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  36.67 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2210  hypothetical protein  35.86 
 
 		 247 aa  139  6e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  35.56 
 
 		 248 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  36.44 
 
 		 243 aa  138  7e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  39.82 
 
 		 248 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  33.75 
 
 		 247 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  33.89 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  33.89 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  33.89 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  33.47 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  33.89 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  37.39 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  33.89 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  35.15 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  35.11 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>