34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2418 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2418  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  100 
 
 		 423 aa  841    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.312206 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0544  replication factor A  71.16 
 
 		 423 aa  600  1e-170  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.384898  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3082  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  68.32 
 
 		 438 aa  560  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.797812  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5196  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  70.12 
 
 		 427 aa  551  1e-156  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0623  replication factor A  67.08 
 
 		 424 aa  518  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.431292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1433  replication factor A  34.94 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.140732 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1374  replication factor A  31.42 
 
 		 450 aa  242  9e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1488  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.07 
 
 		 425 aa  209  7e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.284076  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2026  replication factor A  28.68 
 
 		 433 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.858521 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1362  replication factor A  28.57 
 
 		 426 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000981614  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1443  replication factor A  27.12 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1027  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.51 
 
 		 310 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0873522 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1629  replication factor A  33.02 
 
 		 311 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0136  replication factor A  33.51 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0459  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.53 
 
 		 310 aa  110  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2220  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.51 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1661  hypothetical protein  29.93 
 
 		 533 aa  93.6  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000420689  unclonable  0.000000000000250844 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0024  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.2 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2354  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  25 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0179  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  25.77 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0258267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2542  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  25.15 
 
 		 609 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.511869  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0565  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.63 
 
 		 482 aa  61.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.361245 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2247  replication factor A  30.41 
 
 		 486 aa  60.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2204  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.12 
 
 		 492 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0345  replication factor A  28.23 
 
 		 651 aa  53.1  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.234694  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0176  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.73 
 
 		 148 aa  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0355  replication factor A  26.72 
 
 		 641 aa  51.6  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.860851  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0561  replication factor A  25.62 
 
 		 642 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.270799  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1627  replication factor A  25.1 
 
 		 642 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0111  replication factor A  26.18 
 
 		 501 aa  47.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0286  replication factor A  25.31 
 
 		 641 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.439991  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0669  single-stranded DNA-binding protein  29.03 
 
 		 158 aa  45.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00307964 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0963  replication factor A  23.05 
 
 		 484 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0206  single-stranded DNA-binding protein  31.68 
 
 		 142 aa  43.5  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.347589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>