39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0286 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1627  replication factor A  95.48 
 
 		 642 aa  1229    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0286  replication factor A  100 
 
 		 641 aa  1285    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.439991  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0355  replication factor A  70.94 
 
 		 641 aa  947    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.860851  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0561  replication factor A  93.76 
 
 		 642 aa  1183    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.270799  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0345  replication factor A  48 
 
 		 651 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.234694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0963  replication factor A  29.18 
 
 		 484 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0886  replication factor A  34.33 
 
 		 371 aa  169  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1764  replication factor A  29.34 
 
 		 373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0111  replication factor A  33.15 
 
 		 501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2204  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.62 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2247  replication factor A  34.7 
 
 		 486 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0415  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.72 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0565  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.89 
 
 		 482 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.361245 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1917  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  24.78 
 
 		 429 aa  101  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2098  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  25 
 
 		 435 aa  90.9  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0089  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.87 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.235418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2941  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  25.75 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0046707  normal  0.642242 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0635  hypothetical protein  25.7 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0039  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  22.38 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1488  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.69 
 
 		 425 aa  70.1  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.284076  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2542  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  22.47 
 
 		 609 aa  69.7  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.511869  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1433  replication factor A  23.79 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.140732 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0669  single-stranded DNA-binding protein  29.51 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00307964 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0176  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.2 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1127  hypothetical protein  27.49 
 
 		 298 aa  56.2  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0544  replication factor A  29.07 
 
 		 423 aa  54.3  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.384898  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0797  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  30.53 
 
 		 137 aa  52  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0630  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  27.74 
 
 		 486 aa  51.6  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0179  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  23.01 
 
 		 416 aa  50.4  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0258267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1443  replication factor A  26.74 
 
 		 405 aa  50.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3082  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  22.55 
 
 		 438 aa  48.9  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.797812  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0206  single-stranded DNA-binding protein  29.79 
 
 		 142 aa  48.1  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.347589  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0830  hypothetical protein  25.5 
 
 		 299 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1362  replication factor A  21.67 
 
 		 426 aa  46.6  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000981614  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1248  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.21 
 
 		 149 aa  46.2  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1556  hypothetical protein  26.24 
 
 		 299 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5196  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  23.31 
 
 		 427 aa  44.3  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2418  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  23.47 
 
 		 423 aa  44.3  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.312206 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1121  hypothetical protein  26.13 
 
 		 299 aa  43.9  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>