34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2542 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2542  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  100 
 
 		 609 aa  1252    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.511869  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1661  hypothetical protein  42.83 
 
 		 533 aa  359  9.999999999999999e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000420689  unclonable  0.000000000000250844 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0024  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  50 
 
 		 410 aa  349  8e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0179  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  47.56 
 
 		 416 aa  340  4e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0258267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2354  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  47.29 
 
 		 419 aa  330  4e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1443  replication factor A  38.14 
 
 		 405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2026  replication factor A  32.15 
 
 		 433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.858521 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0136  replication factor A  41.58 
 
 		 308 aa  136  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1629  replication factor A  38.03 
 
 		 311 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1362  replication factor A  28.18 
 
 		 426 aa  135  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000981614  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1027  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  38.46 
 
 		 310 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0873522 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0459  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  36.28 
 
 		 310 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2220  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  36.84 
 
 		 309 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1433  replication factor A  27.24 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.140732 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0544  replication factor A  26.9 
 
 		 423 aa  73.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.384898  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3082  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  26.76 
 
 		 438 aa  72  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.797812  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1488  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  24.04 
 
 		 425 aa  72  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.284076  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0355  replication factor A  21.57 
 
 		 641 aa  71.6  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.860851  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1627  replication factor A  21.99 
 
 		 642 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4985  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  38.37 
 
 		 126 aa  65.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0632709  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0286  replication factor A  22.32 
 
 		 641 aa  63.9  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.439991  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5196  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.11 
 
 		 427 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0561  replication factor A  22.35 
 
 		 642 aa  61.6  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.270799  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0345  replication factor A  20.87 
 
 		 651 aa  61.2  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.234694  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3149  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.71 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1374  replication factor A  25.63 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2418  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.4 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.312206 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4182  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.56 
 
 		 287 aa  55.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1694  hypothetical protein  25.66 
 
 		 282 aa  55.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2973  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.76 
 
 		 282 aa  53.5  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0623  replication factor A  25.62 
 
 		 424 aa  53.5  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.431292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1730  UvrD/REP helicase  31.65 
 
 		 916 aa  52.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4969  hypothetical protein  28.75 
 
 		 293 aa  45.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.543299  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2941  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  21.61 
 
 		 429 aa  43.9  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0046707  normal  0.642242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>