28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0136 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0136  replication factor A  100 
 
 		 308 aa  609  1e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1629  replication factor A  70.1 
 
 		 311 aa  434  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0459  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  67.1 
 
 		 310 aa  433  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1027  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  70.32 
 
 		 310 aa  429  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0873522 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2220  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  67.31 
 
 		 309 aa  415  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1443  replication factor A  49.78 
 
 		 405 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1362  replication factor A  48.09 
 
 		 426 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000981614  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2026  replication factor A  48.4 
 
 		 433 aa  227  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.858521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0024  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  41.78 
 
 		 410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1661  hypothetical protein  39.25 
 
 		 533 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000420689  unclonable  0.000000000000250844 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2354  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  40.18 
 
 		 419 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2542  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  41.58 
 
 		 609 aa  136  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.511869  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5196  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  37.7 
 
 		 427 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3082  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  37.31 
 
 		 438 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.797812  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0179  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  37.44 
 
 		 416 aa  122  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0258267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0544  replication factor A  34.26 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.384898  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2418  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.51 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.312206 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0623  replication factor A  36.65 
 
 		 424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.431292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1433  replication factor A  33.83 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.140732 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1488  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.14 
 
 		 425 aa  94  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.284076  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1374  replication factor A  30.5 
 
 		 450 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1730  UvrD/REP helicase  35.14 
 
 		 916 aa  56.6  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4182  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  36.59 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2973  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  41.27 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4969  hypothetical protein  38.33 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.543299  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1694  hypothetical protein  32.43 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4985  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.71 
 
 		 126 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0632709  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3149  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  36.23 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>