28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1629 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1629  replication factor A  100 
 
 		 311 aa  624  1e-178  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1027  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  79.1 
 
 		 310 aa  496  1e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0873522 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0459  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  72.12 
 
 		 310 aa  462  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2220  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  72.03 
 
 		 309 aa  445  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0136  replication factor A  70.1 
 
 		 308 aa  434  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1443  replication factor A  51.05 
 
 		 405 aa  257  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1362  replication factor A  46.98 
 
 		 426 aa  228  9e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000981614  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2026  replication factor A  49.05 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.858521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0024  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  42.38 
 
 		 410 aa  153  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2354  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  41.47 
 
 		 419 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1661  hypothetical protein  35.74 
 
 		 533 aa  140  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000420689  unclonable  0.000000000000250844 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0179  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  38.39 
 
 		 416 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0258267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5196  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  37.61 
 
 		 427 aa  135  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2542  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  38.03 
 
 		 609 aa  135  8e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.511869  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0544  replication factor A  36.73 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.384898  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3082  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  37.7 
 
 		 438 aa  132  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.797812  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0623  replication factor A  37.17 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.431292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2418  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.02 
 
 		 423 aa  112  8.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.312206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1433  replication factor A  33.83 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.140732 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1374  replication factor A  27.85 
 
 		 450 aa  97.4  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1488  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.71 
 
 		 425 aa  96.3  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.284076  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4182  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  45.71 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1730  UvrD/REP helicase  43.42 
 
 		 916 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1694  hypothetical protein  42.67 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2973  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  44.93 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4969  hypothetical protein  35.29 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.543299  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3149  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  39.71 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4985  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.08 
 
 		 126 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0632709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>