32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0179 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0179  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  100 
 
 		 416 aa  859    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0258267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2354  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  58.82 
 
 		 419 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0024  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  57.93 
 
 		 410 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2542  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  47.56 
 
 		 609 aa  340  2e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.511869  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1661  hypothetical protein  43.75 
 
 		 533 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000420689  unclonable  0.000000000000250844 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1443  replication factor A  36.28 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2026  replication factor A  31.76 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.858521 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1362  replication factor A  30.54 
 
 		 426 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000981614  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1027  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  39.25 
 
 		 310 aa  139  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0873522 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1629  replication factor A  38.39 
 
 		 311 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0459  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.33 
 
 		 310 aa  126  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0136  replication factor A  37.44 
 
 		 308 aa  122  9e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2220  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  36.36 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1488  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  26.34 
 
 		 425 aa  94.4  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.284076  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1433  replication factor A  25.83 
 
 		 441 aa  86.7  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.140732 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3082  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.59 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.797812  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0544  replication factor A  26.07 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.384898  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1374  replication factor A  23.7 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2418  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  25.77 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.312206 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5196  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  26.75 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0623  replication factor A  24.09 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.431292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4985  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  39.24 
 
 		 126 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0632709  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4182  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  43.33 
 
 		 287 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1730  UvrD/REP helicase  37.08 
 
 		 916 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0561  replication factor A  22.71 
 
 		 642 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.270799  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0345  replication factor A  25.44 
 
 		 651 aa  50.4  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.234694  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0286  replication factor A  23.01 
 
 		 641 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.439991  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3149  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  35.14 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1627  replication factor A  23.1 
 
 		 642 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1694  hypothetical protein  42.31 
 
 		 282 aa  47  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4969  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  46.6  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.543299  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2973  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  44.23 
 
 		 282 aa  46.6  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>