38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0561 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1627  replication factor A  95.48 
 
 		 642 aa  1233    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0286  replication factor A  93.76 
 
 		 641 aa  1184    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.439991  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0355  replication factor A  70.56 
 
 		 641 aa  935    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.860851  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0561  replication factor A  100 
 
 		 642 aa  1283    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.270799  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0345  replication factor A  48.39 
 
 		 651 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.234694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0963  replication factor A  28.86 
 
 		 484 aa  167  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0886  replication factor A  33.93 
 
 		 371 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1764  replication factor A  28.41 
 
 		 373 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2204  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  26.88 
 
 		 492 aa  122  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0111  replication factor A  32.58 
 
 		 501 aa  122  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2247  replication factor A  35.03 
 
 		 486 aa  118  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0565  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.33 
 
 		 482 aa  109  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.361245 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0415  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  26.83 
 
 		 487 aa  107  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1917  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  24.86 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2098  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  24.02 
 
 		 435 aa  90.1  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2941  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  25.08 
 
 		 429 aa  87.8  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0046707  normal  0.642242 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0635  hypothetical protein  26.27 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0089  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  26.74 
 
 		 466 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.235418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0039  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  22.16 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2542  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  22.51 
 
 		 609 aa  68.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.511869  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1488  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.69 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.284076  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1433  replication factor A  24.12 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.140732 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0669  single-stranded DNA-binding protein  30.33 
 
 		 158 aa  63.2  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00307964 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0176  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  35.78 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3082  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  23.28 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.797812  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0797  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.63 
 
 		 137 aa  55.5  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1127  hypothetical protein  26.61 
 
 		 298 aa  53.1  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0544  replication factor A  29.07 
 
 		 423 aa  53.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.384898  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0630  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  28.99 
 
 		 486 aa  52.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0179  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  22.71 
 
 		 416 aa  52.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0258267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0206  single-stranded DNA-binding protein  29.52 
 
 		 142 aa  51.6  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.347589  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5196  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  22.63 
 
 		 427 aa  51.2  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1443  replication factor A  25.15 
 
 		 405 aa  48.9  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0830  hypothetical protein  26 
 
 		 299 aa  47.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1374  replication factor A  25.19 
 
 		 450 aa  46.2  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2418  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  24.07 
 
 		 423 aa  46.2  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.312206 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1362  replication factor A  20.43 
 
 		 426 aa  44.3  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000981614  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1556  hypothetical protein  26.45 
 
 		 299 aa  43.9  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>