32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0963 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0963  replication factor A  100 
 
 		 484 aa  963    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1764  replication factor A  49.73 
 
 		 373 aa  385  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0886  replication factor A  38.04 
 
 		 371 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2204  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  41.89 
 
 		 492 aa  239  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0415  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  41.3 
 
 		 487 aa  227  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2247  replication factor A  37.61 
 
 		 486 aa  219  8.999999999999998e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0111  replication factor A  37.87 
 
 		 501 aa  212  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0565  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  37.9 
 
 		 482 aa  203  5e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.361245 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0355  replication factor A  28.14 
 
 		 641 aa  174  5e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.860851  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1627  replication factor A  29.66 
 
 		 642 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0345  replication factor A  29.41 
 
 		 651 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.234694  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0286  replication factor A  29.52 
 
 		 641 aa  160  6e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.439991  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2098  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  30.63 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0561  replication factor A  28.63 
 
 		 642 aa  153  7e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.270799  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1917  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  30.77 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0039  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  26.93 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2941  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  29.84 
 
 		 429 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0046707  normal  0.642242 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0635  hypothetical protein  28.19 
 
 		 424 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0089  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  21.6 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.235418 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1488  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.51 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.284076  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0669  single-stranded DNA-binding protein  37.62 
 
 		 158 aa  65.5  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00307964 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0206  single-stranded DNA-binding protein  35.2 
 
 		 142 aa  62.4  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.347589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0176  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  34.02 
 
 		 148 aa  55.5  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02690  damaged DNA binding protein, putative  30.39 
 
 		 597 aa  54.7  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1433  replication factor A  25.43 
 
 		 441 aa  53.5  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.140732 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0797  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.32 
 
 		 137 aa  53.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3082  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  25.86 
 
 		 438 aa  51.2  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.797812  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1443  replication factor A  26.89 
 
 		 405 aa  47.4  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0456  hypothetical protein  26.88 
 
 		 122 aa  44.3  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5196  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  24.18 
 
 		 427 aa  43.9  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07423  subunit of heterotrimeric Replication Factor (Eurofung)  26.78 
 
 		 603 aa  43.9  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000000000373971 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1248  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  24.18 
 
 		 149 aa  43.5  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>