15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1248 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1248  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  100 
 
 		 149 aa  296  5e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0635  hypothetical protein  32.11 
 
 		 424 aa  52.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0415  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.86 
 
 		 487 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2204  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.47 
 
 		 492 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1764  replication factor A  26.49 
 
 		 373 aa  48.9  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0565  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.03 
 
 		 482 aa  43.9  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.361245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0963  replication factor A  24.18 
 
 		 484 aa  43.5  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2941  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  33.02 
 
 		 429 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0046707  normal  0.642242 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1917  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  28.04 
 
 		 429 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2098  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  30.63 
 
 		 435 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0089  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  30.37 
 
 		 466 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.235418 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2247  replication factor A  26.71 
 
 		 486 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1627  replication factor A  28.87 
 
 		 642 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0886  replication factor A  23.97 
 
 		 371 aa  40  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0355  replication factor A  26.95 
 
 		 641 aa  40  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.860851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>