22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0206 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0206  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 142 aa  286  6e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.347589  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0456  hypothetical protein  40.8 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0797  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  37.4 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0963  replication factor A  35.2 
 
 		 484 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0111  replication factor A  34.71 
 
 		 501 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1764  replication factor A  26.61 
 
 		 373 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0669  single-stranded DNA-binding protein  29.46 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00307964 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0565  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  34.62 
 
 		 482 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.361245 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2247  replication factor A  37.36 
 
 		 486 aa  53.9  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2204  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  34.48 
 
 		 492 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0561  replication factor A  29.13 
 
 		 642 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.270799  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0176  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.78 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0415  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  43.28 
 
 		 487 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1433  replication factor A  25.89 
 
 		 441 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.140732 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1627  replication factor A  28.57 
 
 		 642 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0286  replication factor A  29.31 
 
 		 641 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.439991  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0886  replication factor A  31.58 
 
 		 371 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_55046  DNA binding protein  44.93 
 
 		 406 aa  47.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1488  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  30.93 
 
 		 425 aa  47  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.284076  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0355  replication factor A  26.45 
 
 		 641 aa  45.1  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.860851  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2418  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.68 
 
 		 423 aa  43.5  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.312206 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3082  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.68 
 
 		 438 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.797812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>