34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3082 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013747  Htur_5196  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  87.32 
 
 		 427 aa  691    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3082  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  100 
 
 		 438 aa  864    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.797812  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2418  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  68.79 
 
 		 423 aa  567  1e-160  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.312206 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0544  replication factor A  61.94 
 
 		 423 aa  520  1e-146  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.384898  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0623  replication factor A  61.63 
 
 		 424 aa  488  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.431292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1433  replication factor A  34.61 
 
 		 441 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.140732 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1374  replication factor A  31 
 
 		 450 aa  242  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1488  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.88 
 
 		 425 aa  206  7e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.284076  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2026  replication factor A  28.57 
 
 		 433 aa  156  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.858521 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1362  replication factor A  28.5 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000981614  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1027  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  39.79 
 
 		 310 aa  143  8e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0873522 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1443  replication factor A  27.85 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1629  replication factor A  37.7 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0459  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  35.05 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0136  replication factor A  37.31 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2220  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  37.17 
 
 		 309 aa  124  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1661  hypothetical protein  30.8 
 
 		 533 aa  104  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000420689  unclonable  0.000000000000250844 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2354  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  27.59 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0179  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  28.1 
 
 		 416 aa  94  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0258267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0024  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.78 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2542  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  26.76 
 
 		 609 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.511869  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2204  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.73 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0561  replication factor A  23.28 
 
 		 642 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.270799  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0345  replication factor A  22.13 
 
 		 651 aa  52.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.234694  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0111  replication factor A  28.09 
 
 		 501 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0565  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.86 
 
 		 482 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.361245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0963  replication factor A  25.16 
 
 		 484 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0176  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  36.59 
 
 		 148 aa  51.2  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0355  replication factor A  23.17 
 
 		 641 aa  50.4  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.860851  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0286  replication factor A  22.55 
 
 		 641 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.439991  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1627  replication factor A  24.49 
 
 		 642 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0669  single-stranded DNA-binding protein  28.89 
 
 		 158 aa  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00307964 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0415  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.76 
 
 		 487 aa  46.6  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0886  replication factor A  24.47 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>