28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0565 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0565  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  100 
 
 
482 aa  924    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.361245 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2247  replication factor A  68.43 
 
 
486 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2204  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  62.17 
 
 
492 aa  555  1e-157  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0415  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  62.85 
 
 
487 aa  551  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0111  replication factor A  60.51 
 
 
501 aa  522  1e-147  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1764  replication factor A  37.4 
 
 
373 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0963  replication factor A  37.9 
 
 
484 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0886  replication factor A  34.88 
 
 
371 aa  204  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1917  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  33.33 
 
 
429 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2941  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  27.02 
 
 
429 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0046707  normal  0.642242 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2098  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  29.82 
 
 
435 aa  123  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0355  replication factor A  27.68 
 
 
641 aa  119  9e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.860851  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0635  hypothetical protein  29.8 
 
 
424 aa  113  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1627  replication factor A  33.89 
 
 
642 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0286  replication factor A  33.89 
 
 
641 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.439991  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0039  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.39 
 
 
426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0561  replication factor A  33.33 
 
 
642 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.270799  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0345  replication factor A  28.54 
 
 
651 aa  104  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.234694  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2418  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.63 
 
 
423 aa  54.7  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.312206 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0206  single-stranded DNA-binding protein  36.26 
 
 
142 aa  53.9  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.347589  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3082  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.86 
 
 
438 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.797812  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1248  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.57 
 
 
149 aa  52.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0089  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  26.29 
 
 
466 aa  51.6  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.235418 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1661  hypothetical protein  26.22 
 
 
533 aa  47  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000420689  unclonable  0.000000000000250844 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5196  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  35 
 
 
427 aa  46.6  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0797  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.84 
 
 
137 aa  45.8  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0669  single-stranded DNA-binding protein  25.71 
 
 
158 aa  43.5  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00307964 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0176  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.79 
 
 
148 aa  43.1  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>