29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2354 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2354  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  100 
 
 		 419 aa  858    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0024  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  60.86 
 
 		 410 aa  548  1e-155  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0179  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  58.82 
 
 		 416 aa  515  1.0000000000000001e-145  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0258267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2542  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  47.29 
 
 		 609 aa  330  3e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.511869  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1661  hypothetical protein  45.53 
 
 		 533 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000420689  unclonable  0.000000000000250844 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1443  replication factor A  35.39 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2026  replication factor A  33.49 
 
 		 433 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.858521 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1362  replication factor A  31.92 
 
 		 426 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000981614  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1027  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  42.99 
 
 		 310 aa  150  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0873522 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0459  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  39.83 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1629  replication factor A  41.47 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0136  replication factor A  40.18 
 
 		 308 aa  138  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2220  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  39.64 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1374  replication factor A  25.84 
 
 		 450 aa  99.8  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1433  replication factor A  25.67 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.140732 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3082  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.59 
 
 		 438 aa  92.8  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.797812  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5196  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  26.85 
 
 		 427 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1488  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  26.79 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.284076  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0544  replication factor A  26.49 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.384898  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2418  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  23.87 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.312206 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0623  replication factor A  26.43 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.431292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4985  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  40.54 
 
 		 126 aa  57.4  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0632709  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3149  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.78 
 
 		 299 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1730  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 916 aa  50.8  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4182  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.87 
 
 		 287 aa  50.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1694  hypothetical protein  33.82 
 
 		 282 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2973  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.63 
 
 		 282 aa  46.6  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1627  replication factor A  22.92 
 
 		 642 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4969  hypothetical protein  29.87 
 
 		 293 aa  43.5  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.543299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>